Archivos De Resultados Del Análisis Secundario De Dragen - Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Tipo de archivo
Archivos de filtro
Archivos InterOp
Archivo de
información del
experimento
Archivos de resultados del análisis secundario de
DRAGEN
La plataforma de tecnología bioinformática DRAGEN analiza sus resultados de secuenciación
integrados en el instrumento más en detalle utilizando uno de los siguientes procesos de análisis.
• BCL Convert (Conversión de BCL)
• Germline (Línea germinal)
• RNA (ARN)
Enrichment (Enriquecimiento)
•
Single Cell RNA (ARN de células únicas)
•
Amplicones de ADN
•
En esta sección, se ofrece información sobre cada proceso de DRAGEN, incluida la información del
archivo de resultados. Además de generar archivos específicos de cada proceso, DRAGEN ofrece
mediciones del análisis en un archivo <nombre_muestra>.metrics.json y los informes descritos en
Proceso DRAGEN BCL Convert en
la página del sitio de asistencia de la plataforma de tecnología bioinformática
Todos los procesos de DRAGEN permiten la descompresión de archivos de entrada BCL y la
compresión de archivos de salida BAM/CRAM.
Consideraciones sobre el archivo de resultados:
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Descripción, ubicación y nombre del archivo
El archivo de filtro especifica si los grupos han superado los filtros. Estos
archivos se generan en el ciclo 26 mediante el uso de 25 ciclos de datos.
Para cada placa, se genera un archivo de filtro.
Datos/Intensidades/LlamadaBases/L001
s_[carril]_[placa].filter
Los archivos de informe binarios se pueden visualizar integrados en el
instrumento con el software de control del instrumento o fuera de él en SAV
o BaseSpace Sequence Hub. Los archivos InterOp se actualizan durante el
experimento.
Carpeta InterOp
Indica el nombre del experimento, el número de ciclos de cada lectura, si la
lectura es una Lectura del índice, y el número de sectores y placas de la celda
de flujo. El archivo de información del experimento se crea al inicio del
experimento.
[Carpeta raíz], RunInfo.xml
la página 76. Para obtener más información sobre DRAGEN, consulte
DRAGEN.
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