Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario página 113

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Requisitos del proceso DRAGEN RNA
Estos son los campos y descripciones de [DragenRNA_Settings] disponibles.
Campo
SoftwareVersion
ReferenceGenomeDir
RnaGeneAnnotationFile
MapAlignOutFormat
KeepFastq
DifferentialExpressionEnable
Estos son los campos y descripciones de [DragenRna_Data] disponibles.
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Necesario Descripción
Sí La versión del software DRAGEN instalada
actualmente en el sistema. Utilice los tres
números enteros incluidos en el nombre de la
versión. Por ejemplo, 3.5.7.
La versión del software debe coincidir con la
versión especificada en la sección BCLConvert_
Settings.
Sí El nombre del genoma de referencia. Por
ejemplo, hg38_noalt_with_decoy. Utilice el
nombre del genoma de referencia de
/usr/local/illumina/genomes. Para utilizar
un genoma de referencia personalizado,
consulte la Ayuda en línea de la aplicación
Reference Builder para Illumina Instruments
v1.0.0.
No El archivo que contiene anotaciones genéticas
de ARN. Solo se permiten caracteres
alfanuméricos. Si no se suministra, se utiliza el
archivo de anotaciones predeterminado incluido
en el genoma de referencia especificado.
No El formato del archivo de resultados. Los valores
permitidos son bam o cram. Si no se especifica
ningún valor, no hay ningún valor
predeterminado.
No Para guardar archivos de resultados FASTQ,
escriba true (verdadero). Para eliminar archivos
de resultados FASTQ, escriba false (falso).
No Para habilitar la expresión genética diferencial,
escriba true (verdadero). Escriba false (falso)
para excluir expresiones genéticas diferenciales
del análisis.
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