Informe De Estadísticas De Demultiplexado - Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Componente
Asignación o alineación
Clasificación de células o
genes
Informes del análisis
Proceso DRAGEN BCL Convert
El proceso DRAGEN BLC Convert utiliza los datos de BCL generados por su experimento de
secuenciación y la información de la hoja de muestras para generar un archivo FASTQ. El nombre de
archivo FASTQ es <nombre_muestra>.fastq.gz.
El proceso genera los siguientes informes.
Componente
Demultiplexado
Criterio de medición del
adaptador
Salto de índices
Principales códigos de
barras desconocidos
Informe de estadísticas de demultiplexado
El informe de estadísticas de demultiplexado contiene información sobre el número de lecturas que
superan el filtro asignadas a cada muestra en la hoja de muestras. Todas las lecturas que no estén
claramente asociadas a una muestra se clasifican como indeterminadas. El informe también incluye
información sobre las puntuaciones de calidad de las bases en las lecturas que superan el filtro
asignadas a cada muestra.
Se incluye la siguiente información.
Criterio de medición
Lane
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Tipo Nombre del archivo de resultados
BAM o •
•
CRAM
TSV, CSV y •
MTX
•
•
HTML <nombre_de_muestra>.dragen.scrna-
report.*.html
Tipo Nombre del archivo de resultados
CSV •
CSV •
CSV •
CSV •
Descripción
El carril de la celda de flujo donde se ha secuenciado la muestra.
<nombre_muestra>.bam o
<nombre_muestra>.cram
<nombre_de_
muestra>.scRNA.barcodeSummary.tsv
<nombre_de_muestra>.scRNA.genes.tsv
<nombre_de_muestra>.scRNA.matrix.mtx
Demultiplex_Stats.csv
Adapter_Metrics.csv
Index_Hopping_Counts.csv
Top_Unknown_Barcodes.csv
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