Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario página 118

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Campo
SoftwareVersion
ReferenceGenomeDir
RnaLibraryType
RnaGeneAnnotationFile
BarcodeRead
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Necesario Descripción
Sí La versión del software DRAGEN instalada
actualmente en el sistema. Utilice los tres
números enteros incluidos en el nombre de la
versión. Por ejemplo, 3.5.7.
La versión del software debe coincidir con la
versión especificada en la sección BCLConvert_
Settings.
Sí El nombre del genoma de referencia. Por
ejemplo, hg38_alt_aware. Los genomas de
referencia se encuentran en
/usr/local/illumina/genomes. Para utilizar
un genoma de referencia personalizado,
consulte la Ayuda en línea de la aplicación
Reference Builder para Illumina Instruments
v1.0.0.
No Introduzca uno de los valores siguientes:
• SF: Stranded forward (cadena directa). SF es
el valor predeterminado.
• SR: Stranded reverse (cadena inversa).
• U: Unstranded (sin cadena).
No El archivo que contiene anotaciones genéticas
de ARN. Solo se permiten caracteres
alfanuméricos. Si no se suministra, se utiliza el
archivo de anotaciones predeterminado incluido
en el genoma de referencia especificado.
No La ubicación dentro del experimento de
secuenciación del código de barras leído, que
contiene tanto el código de barras como los UMI.
Los valores pueden contener Read1 (Lectura 1) o
Read2 (Lectura 2). El valor predeterminado es
Read1 (Lectura 1).
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