Estructura De Carpetas De Resultados De Análisis Secundario De Dragen - Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Estructura de carpetas de resultados de análisis
secundario de DRAGEN
DRAGEN genera de forma predeterminada los archivos de resultados en la carpeta de resultados
seleccionada en la pestaña Settings (Configuración). Para cada flujo de trabajo, DRAGEN elabora un
informe a modo de resumen en el archivo report.html.
Data (Datos)
report.html (informe.html)
report_files (archivos_informe)
AggregateFastQCPlots (ConjuntoDeGráficosDeFastQC)
*.png
*stderr_.txt
*stdout_.txt
dragen_prev_48_hrs.log
dlm_prev_48_hrs.log
SampleSheet.csv (HojaDeMuestras.csv)
Run input files (eg, BED, GTF files) (Archivos de entrada de experimentos (p. ej. archivos
BED, GTF))
sample_name (nombre_de_muestra)
enrich_caller , germline_seq, dna_amplicon_seq, rna_seq, or scrna_seq (llamador_enriq, sec_
germinal, amplicón_sec_adn, sec_arn o sec_arncs)
sample_name (nombre_de_muestra)
*.png
dragen_*.log
sample_name.*.metrics.csv (nombre_de_muestra.*.mediciones.csv)
[DNA] sample_name.*.vcf.gz ([ADN] nombre_de_muestra.*.vcf.gz)
[DNA] sample_name.*.gvcf.gz ([ADN] nombre_de_muestra.*.gvcf.gz): no disponible para
el proceso (somático) de amplicones de la plataforma de tecnología bioinformática DRAGEN
Bio-IT.
sample_name.*.bam or sample_name.*.cram (nombre_de_muestra.*.bam o nombre_de_
muestra.*.cram)
Logs (Registros)
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
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