Secuenciación Mediante Ciclo De Oscuridad; Edición Del Archivo De La Fórmula - Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Secuenciación mediante ciclo de oscuridad
En esta sección se describe el uso de la secuenciación mediante ciclo de oscuridad en la fórmula.
La secuenciación mediante ciclo de oscuridad se utiliza tan solo para completar los pasos del proceso
químico de un ciclo de secuenciación. Consulte la página Compatible Products (Productos compatibles)
para su kit de preparación de bibliotecas en el
secuenciación mediante ciclo de oscuridad.
Siga los pasos siguientes para la secuenciación mediante ciclo de oscuridad.
Edición del archivo de la fórmula
1. Descargue el archivo XML de la fórmula del
2. Edite el archivo XML de la fórmula.
a. Identifique la sección correspondiente del protocolo en función de su configuración de lectura
del índice y de secuenciación de índice. Hay seis posibles protocolos diferentes por fórmula
personalizada que se pueden editar.
Por ejemplo, el protocolo para una Lectura 1 única sin configuración de secuenciación de índice
sería <Protocol Name="1 Read 0 Index" ProtocolType="1Read0Index" >.
b. Antes de <ReadRef ReadName="Read 1"/> y <ReadRef ReadName="Read 2"/>, introduzca
el siguiente paso de ciclo de oscuridad en una nueva línea.
<DarkCycle ChemistryName="Dark Cycle Before First Base" />.
c. Introduzca el paso de ciclo de oscuridad en una nueva línea para cada ciclo sin etiquetar
requerido.
3. Guarde el archivo XML de la fórmula.
A continuación, se muestra una fórmula de muestra con ciclo de oscuridad:
<Protocol Name="1 Read 0 Index" ProtocolType="1Read0Index" >
<ChemistryRef ChemistryName="Start" />
<ChemistryRef ChemistryName="Prime Cartridge" />
<ChemistryRef ChemistryName="BIX Mixing" />
<ChemistryRef ChemistryName="Prime Cartridge" />
<ChemistryRef ChemistryName="ExAmp Transfer" />
<ChemistryRef ChemistryName="ExAmp Mixing" />
<ChemistryRef ChemistryName="Prime Cartridge" />
<Obdd ChemistryName="Library Denaturation and Dilution" />
<ChemistryRef ChemistryName="Prime Cartridge" />
<Obcg ChemistryName="Cluster Generation" />
<ChemistryRef ChemistryName="SBS Prime" />
<ChemistryRef ChemistryName="Read Prep" />
<DarkCycle ChemistryName="Dark Cycle Before First Base" />
<ReadRef ReadName="Read 1" />
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
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para saber si se requiere la
Illumina.
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