Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario página 84

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Nombre de archivo
Control_vs_
Comparison.genes.ma.png
Control_vs_
Comparison.genes.pca.png
Control_vs_Comparison.genes.res.csv
Control_vs_
Comparison.genes.rlog.csv
Proceso DRAGEN Single Cell RNA
El DRAGEN admite las siguientes funciones:
Demultiplexado de muestras
•
Mapeo y alineación, incluida la clasificación y el marcado de duplicados
•
Clasificación de células y genes
•
Para generar archivos de resultados, especifique un archivo GTF en la hoja de muestra o asegúrese de
que exista genes.gtf.gz con el genoma de referencia.
El proceso genera los siguientes archivos de resultados.
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Descripción
Contiene la variación de las relaciones de expresión
genética como una función de la intensidad de señal
promedio. Para mostrar las diferencias entre las
mediciones tomadas en dos muestras, el gráfico
transforma los datos en M (relación logarítmica) y A
(promedio) La gráfica MA muestra las modulaciones
log2 atribuibles a una variable dada sobre la media de
los recuentos normalizados de todas las muestras. Si
el valor de P ajustado es menor que 0,1, los puntos se
muestran en rojo. Los puntos que se encuentran
fuera de la ventana se representan como triángulos
abiertos. Los triángulos que apuntan hacia arriba
representan una modulación log positiva. Los
triángulos que apuntan hacia abajo representan una
modulación log negativa.
La gráfica representa los primeros dos componentes
principales que explican la mayor varianza.
Contiene los resultados DESeq2, que describen la
expresión media, log2 (modulación), error estándar
de log2, valor de P, valor de P ajustado y el estado de
expresión de cada gen.
Contiene recuentos regularizados de transformación
logarítmica calculados mediante DESeq2.
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