Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario página 48

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
2. Seleccione un formato de resultados de asignación o alineación.
3. Seleccione si quiere guardar una copia de sus archivos FASTQ. Los archivos FASTQ solo se
generan si selecciona la opción de conservarlos.
4. Seleccione una de las opciones de formato de salida FASTQ siguientes:
gzip: guarda los archivos FASTQ en formato gzip.
•
DRAGEN: guarda los archivos FASTQ en formato ora.
•
5. Finalice la configuración del experimento.
Para enviar la configuración del experimento a su cuenta de BaseSpace Sequence Hub,
•
seleccione Submit Run (Enviar experimento). Los experimentos enviados a BaseSpace
Sequence Hub aparecen en la lista de experimentos planificados y están disponibles para
los sistemas utilizando el modo Cloud (Nube) o el modo Hybrid (Híbrido).
• Para guardar la configuración del experimento como una hoja de muestras con formato de
archivo v2, seleccione Export Sample Sheet (Exportar hoja de muestras) en la lista
desplegable Submit Run (Enviar experimento). La hoja de muestras y los archivos de
soporte del análisis secundario se descargan en una carpeta *.zip y son necesarios para
iniciar experimentos en sistemas que utilizan el modo Local. Esta opción solo está
disponible si la ubicación del análisis seleccionada es Local.
Illumina DRAGEN RNA
Utilice los siguientes pasos para configurar el análisis Illumina DRAGEN RNA.
1. Seleccione su genoma de referencia.
Si es posible, utilice un genoma de referencia sin ALT-Aware.
2. Seleccione su formato de resultados de asignación o alineación.
3. Seleccione si quiere guardar una copia de sus archivos FASTQ. Los archivos FASTQ solo se
generan si selecciona la opción de conservarlos.
4. Seleccione una de las opciones de formato de salida FASTQ siguientes:
• gzip: guarda los archivos FASTQ en formato gzip.
• DRAGEN: guarda los archivos FASTQ en formato ora.
5. [Opcional] Cargue un archivo de anotación de ARN en Gene Transfer Format (Formato de
transferencia de genes, GTF).
• Modo Local: seleccione Select Custom File (Local) (Seleccionar archivo personalizado
[Local]) para cargar un único experimento o Upload Custom File (BaseSpace) (Cargar
archivo personalizado [BaseSpace]) para un uso repetido.
• Modo Cloud (Nube) o Hybrid (Híbrido): seleccione Upload Custom File (BaseSpace) (Cargar
archivo personalizado [BaseSpace]). El archivo GTF solo está disponible en el grupo de
trabajo en el que se ha cargado.
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
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