Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Criterio de medición
SampleID
Index
# Reads
# Perfect Index Reads
# One Mismatch Index
Reads
# of ≥ Q30 Bases (PF)
Mean Quality Score
(PF)
Informes de criterios de medición del adaptador
El archivo de criterios de medición del adaptador incluye el número de bases de adaptador y de
muestra asociadas a cada lectura.
Se incluye la siguiente información.
Criterio de
Descripción
medición
Lane
El carril de la celda de flujo donde se ha secuenciado la muestra.
Sample_ID
El ID de la muestra de la hoja de muestras. Si una lectura no se corresponde con
una muestra, el campo muestra undetermined (sin determinar).
index
La secuencia del Índice 1 de la hoja de muestras. El campo está vacío si el índice no
se ha especificado en la hoja de muestras o si el valor del ID de la muestra es
undetermined (sin determinar).
index2
La secuencia de index2 de la hoja de muestras. El campo está vacío si index2 no se
ha especificado en la hoja de muestras o si el valor del ID de la muestra es
undetermined (sin determinar).
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Descripción
El ID de la muestra de la hoja de muestras. Si una lectura no se
corresponde con una muestra, el campo muestra undetermined (sin
determinar).
La concatenación de la lectura del índice 1 y de la lectura del índice 2
de la hoja de muestras se separan mediante un guion. Si una lectura
no se corresponde con una muestra, el campo muestra
undetermined (sin determinar).
El número de lecturas demultiplexadas que pasan el filtro para la
muestra del carril especificado.
Número de lecturas que coinciden perfectamente con las secuencias
de índices combinadas especificadas en la hoja de muestras.
Número de lecturas con un error en las secuencias de índices
combinadas especificadas en la hoja de muestras.
Número de bases, incluidos adaptadores, correspondientes a lecturas
que superan un umbral de calidad Q30.
La puntuación de calidad media de las lecturas correspondientes a la
muestra del carril especificado. El valor incluye bases de adaptador.
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