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Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Planificación de un experimento de secuenciación en
BaseSpace Sequence Hub
Utilice Instrument Run Setup (Configuración del experimento en el instrumento) en BaseSpace
Sequence Hub para crear y configurar los ajustes de su experimento. Si está configurando un
experimento en modo Cloud (Nube) o Hybrid (Híbrido), envíe la configuración del experimento a la lista
de experimentos planificados de su cuenta de BaseSpace Sequence Hub, en la pestaña Planned Runs
(Experimentos planificados) en la que se incluyen los experimentos disponibles para ser secuenciados
en los sistemas de secuenciación NextSeq 1000 y NextSeq 2000. Si está configurando un experimento
en modo Local, utilice Instrument Run Setup (Configuración del experimento en el instrumento) para
crear y exportar su hoja de muestras en formato de archivo v2. O bien, consulte
hoja de muestras v2 en la página 98
utilizando una plantilla proporcionada.
La configuración del experimento en el instrumento en BaseSpace Sequence Hub no permite más de
1536 muestras.
Configuración de experimentos
1.
Navegue hasta BaseSpace Sequence Hub.
2.
Introduzca su dirección de correo electrónico y la contraseña de BaseSpace Sequence Hub y,
a continuación, seleccione Sign In (Iniciar sesión).
3.
Seleccione la ficha Runs (Experimentos), y luego seleccione el desplegable New Run (Nuevo
experimento).
4.
Seleccione NextSeq 1000/2000.
5.
En el campo Run Name (Nombre del experimento), introduzca un nombre único de su preferencia
para identificar el experimento actual.
El nombre del experimento puede contener un máximo de 225 caracteres alfanuméricos, espacios,
guiones y guiones bajos.
6.
Seleccione una de las siguientes ubicaciones de análisis.
•
BaseSpace: analice los datos de secuenciación en la nube.
•
Local: analice los datos de secuenciación integrados en el instrumento o genere una hoja de
muestras v2 para el modo Local o Hybrid (híbrido).
7.
Seleccione un tipo de análisis y la versión.
Para obtener más información sobre los análisis secundarios, consulte
análisis secundario de DRAGEN en la página 70
Sequence Hub. Si selecciona el análisis DRAGEN Single Cell RNA, consulte la página de archivos
productos compatibles de NexSeq 1000/2000 para obtener información sobre la compatibilidad del
kit de preparación de bibliotecas de ARN de células únicas de terceros.
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
para crear una hoja de muestras sin BaseSpace Sequence Hub
o la documentación de la aplicación de BaseSpace
Configuración de la
Archivos de resultados del
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Solución de problemas
