Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario página 50

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
5. Seleccione una de las opciones de formato de salida FASTQ siguientes:
• gzip: guarda los archivos FASTQ en formato gzip.
• DRAGEN: guarda los archivos FASTQ en formato ora.
6. Seleccione la configuración idéntica a su tipo de kit de preparación de bibliotecas.
Por ejemplo, si ha seleccionado Single Cell RNA Library Kit 1 como kit de preparación de bibliotecas
de ARN de células únicas, seleccione el tipo 1 en Configuration Type (Tipo de configuración).
7. Seleccione la lectura de código de barras.
8. [Opcional] Edite el número de bases en los códigos de barras y los identificadores moleculares
exclusivos (UMI, unique molecular identifiers). Los valores se cumplimentan automáticamente en
función del kit de preparación de bibliotecas y el tipo de configuración que haya seleccionado.
9. Seleccione la orientación de la cadena.
10. [Opcional] Seleccione un archivo que contenga sus secuencias de código de barras o cargue un
nuevo archivo personalizado.
11. Si utiliza un tipo de configuración Advanced/Custom (Avanzada/personalizada), introduzca valores
para el número de ciclos de anulación, la posición del código de barras y la posición de UMI.
12. Finalice la configuración del experimento.
Para enviar la configuración del experimento a su cuenta de BaseSpace Sequence Hub,
•
seleccione Submit Run (Enviar experimento). Los experimentos enviados a BaseSpace
Sequence Hub aparecen en la lista de experimentos planificados y están disponibles para
los sistemas utilizando el modo Cloud (Nube) o el modo Hybrid (Híbrido).
Para guardar la configuración del experimento como una hoja de muestras con formato de
•
archivo v2, seleccione Export Sample Sheet (Exportar hoja de muestras) en la lista
desplegable Submit Run (Enviar experimento). La hoja de muestras y los archivos de
soporte del análisis secundario se descargan en una carpeta *.zip si se ha proporcionado
un archivo GTF opcional y son necesarios para iniciar experimentos en sistemas que utilizan
el modo Local. Esta opción solo está disponible si la ubicación del análisis seleccionada es
Local.
Illumina DRAGEN Amplicon
Utilice los siguientes pasos para configurar el análisis Illumina DRAGEN Amplicon.
1. Seleccione su genoma de referencia.
2. Seleccione un archivo *.bed que contenga las regiones a las que le gustaría dirigirse o cargue un
nuevo archivo personalizado.
Asegúrese de que el genoma de referencia del archivo BED coincide con el seleccionado en el paso
1. Si se trata de un nuevo archivo BED personalizado, utilice la siguiente nomenclatura: nombre_
del_panel_númerodeversión.genomadereferencia.bed.
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
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