Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario página 110

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Campo
BarcodeMismatchesIndex2
FastqCompressionFormat
AdapterRead1
AdapterRead2
OverrideCycles
Estos son los campos y descripciones de [BCLConvert_Data] disponibles.
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Necesario Descripción
No El número de incoherencias permitidas entre la
segunda lectura del índice y la secuencia de índice. Los
valores pueden ser 0, 1 o 2. El valor predeterminado es
1.
No Para generar archivos FASTQ en formato *.gz,
introduzca gzip. Para guardar archivos FASTQ en
formato *.ora y utilizar la descompresión en DRAGEN,
introduzca dragen.
No La secuencia que se recortará o enmascarará desde el
final de Lectura 1. Secuencia del adaptador de Lectura
1 que contiene A, C, G o T. AdapterRead1 recorta los
ciclos de manera predeterminada.
No La secuencia que se recortará o enmascarará desde el
final de Lectura 2. Secuencia del adaptador de Lectura
2 que contiene A, C, G o T. AdapterRead2 recorta los
ciclos de manera predeterminada.
No Cadena utilizada para especificar ciclos UMI y
desenmascarar ciclos de una lectura. Se permiten los
siguientes valores:
• N: especifica los ciclos a ignorar.
• Y: especifica los ciclos de secuenciación.
• I: especifica los ciclos de indexado.
• U: especifica los ciclos UMI a recortar.
Cada elemento se separa con punto y coma. A
continuación, tiene ejemplos de entradas de
OverrideCycles.
U8Y143;I8;I8;U8Y143
N10Y66;I6;N10Y66
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