Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario página 46

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Ajuste
BarcodeMismatchesIndex2
OverrideCycles
2. Seleccione si quiere guardar una copia de sus archivos FASTQ. Los archivos FASTQ solo se
generan si selecciona la opción de conservarlos.
3. Seleccione una de las opciones de formato de salida FASTQ siguientes:
• gzip: guarda los archivos FASTQ en formato gzip.
• DRAGEN: guarda los archivos FASTQ en formato ora.
4. Finalice la configuración del experimento.
• Para enviar la configuración del experimento a su cuenta de BaseSpace Sequence Hub,
seleccione Submit Run (Enviar experimento). Los experimentos enviados a BaseSpace
Sequence Hub aparecen en la lista de experimentos planificados y están disponibles para
los sistemas utilizando el modo Cloud (Nube) o el modo Hybrid (Híbrido).
Para guardar la configuración del experimento como una hoja de muestras con formato de
•
archivo v2, seleccione Export Sample Sheet (Exportar hoja de muestras) en la lista
desplegable Submit Run (Enviar experimento). La hoja de muestras es necesaria para
iniciar experimentos en los sistemas utilizando el modo Local. Esta opción solo está
disponible si la ubicación del análisis seleccionada es Local.
Illumina DRAGEN Enrichment
Utilice los siguientes pasos para configurar el análisis Illumina DRAGEN Enrichment.
1. Seleccione un genoma de referencia.
Si es posible, utilice un genoma de referencia con ALT-Aware.
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Descripción
El número de incoherencias permitidas entre la segunda
lectura del índice y la secuencia de índice. El valor
predeterminado es 1. Si un código de barras es de 6 pb, el
valor recomendado es 0.
Cadena utilizada para especificar ciclos UMI y
desenmascarar ciclos de una lectura. Se permiten los
siguientes valores:
• N: especifica los ciclos a ignorar.
• Y: especifica los ciclos de secuenciación.
• I: especifica los ciclos de indexado.
• U: especifica los ciclos UMI a recortar.
Cada elemento se separa con punto y coma.
A continuación, tiene ejemplos de entradas de
OverrideCycles.
U8Y143;I8;I8;U8Y143
N10Y66;I6;N10Y66
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