Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario página 122

Sistema de secuenciación
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Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Campo
UmiPosition
BarcodeSequenceWhitelist
KeepFastq
MapAlignOutFormat
Estos son los campos y descripciones de [DragenSingleCellRNA_Data] disponibles.
Campo
Sample_ID
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Necesario
Descripción
La ubicación de las bases que corresponden al
UMI en el BarCodeRead especificado.
Introduzca la secuencia de caracteres en el
siguiente formato:
<Posición de inicio de UMI>_<posición
final de UMI>
Por ejemplo, si el UMI contiene 8 bases y el
número de bases previas al UMI suma un total
de 51, el valor es 52_59.
No
El nombre del archivo que contiene la secuencia
del código de barras para la lista blanca. El
nombre del archivo solo puede contener
caracteres alfanuméricos, guiones, guiones
bajos y puntos.
No
Para guardar archivos de resultados FASTQ,
escriba true (verdadero). Para eliminar archivos
de resultados FASTQ, escriba false (falso).
No
El formato del archivo de resultados. Los valores
permitidos son bam o cram. Si no se especifica
ningún valor, no hay ningún valor
predeterminado.
Necesario
Descripción
ID de la muestra. El ID de muestra puede
contener un máximo de 20 caracteres
alfanuméricos. El ID distingue entre mayúsculas
y minúsculas. Separe cada identificador con un
guion. Por ejemplo, Muestra1-DQB1-022515.
Los ID de muestra deben coincidir con los ID
especificados en la sección BCLConvert_Data.
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Este manual también es adecuado para:

Nextseq 2000

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