Tabla de contenido
Guía del sistema de secuenciación NextSeq 2000
Flujo de trabajo de análisis en tiempo real
Registro
Extracción de
intensidad
Corrección de hebra
Llamada de bases
Puntuación de
calidad
Registro
El registro alinea una imagen con la matriz cuadrada girada de nanopocillos en la celda de flujo de
tramas. Debido a la disposición ordenada de los nanopocillos, las coordenadas X e Y para cada grupo
de una placa son predeterminadas. Las posiciones de los grupos se recopilan en un archivo de
ubicación de grupos (s.locs) para cada experimento.
Si se produce un error en el registro de cualquier imagen en un ciclo, no se generará ninguna llamada de
bases para esa placa en ese ciclo. Utilice el Visor del análisis de secuenciación para identificar qué
imágenes no se han podido registrar.
Extracción de intensidad
Tras el registro, la extracción de intensidad calcula un valor de intensidad para cada nanopocillo en una
imagen determinada. Si el registro falla, no es posible extraer la intensidad para dicha placa.
Corrección de hebra retrasada
Durante la reacción de secuenciación, cada cadena de ADN de un grupo se amplía en una base por
cada ciclo. Las hebras retrasadas y hebras adelantadas se producen cuando una cadena queda fuera de
su lugar con respecto al ciclo de incorporación actual.
La hebra retrasada se produce cuando una base se atrasa.
La hebra adelantada se produce cuando una base se adelanta.
N.º de documento 1000000109376 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Registra la ubicación de cada grupo en la celda de flujo de tramas.
Determina un valor de intensidad para cada grupo.
Corrige los efectos de hebra retrasada y hebra adelantada.
Determina una llamada de bases para cada grupo.
Asigna una puntuación de calidad a cada llamada de bases.
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