Tabla de contenido
Guía del sistema de secuenciación NextSeq 2000
Figura 5
Hebra retrasada y hebra adelantada
A. Lectura con una base con hebra retrasada
B. Lectura con una base con hebra adelantada
RTA3 corrige los efectos de la hebra retrasada y adelantada, lo que aumenta al máximo la calidad de
los datos en cada uno de los ciclos del experimento.
Llamada de bases
La llamada de bases determina una base (A, C, G o T) para cada grupo de una placa determinada en un
ciclo específico. El sistema de secuenciación NextSeq 2000 utiliza secuenciación de dos canales, que
precisa solo dos imágenes para codificar los datos de cuatro bases de ADN, una del canal verde y una
del canal azul.
Una ausencia de llamada se identifica como N. La ausencia de llamadas se produce cuando un grupo
no supera el filtro, el registro falla o se desplaza un grupo fuera de la imagen.
Las intensidades de cada grupo se extraen de la imagen verde y de la azul y se comparan una con otra,
lo que produce cuatro poblaciones diferenciadas. Cada población se corresponde con una base. El
proceso de llamada de bases determina a qué población pertenece cada grupo.
Tabla 6 Llamada de bases en secuenciación de dos canales
Canal
Base
verde
A
1
(presente)
(presente)
C
0
(ausente)
(presente)
G
0
(ausente)
(ausente)
T
1
(presente)
(ausente)
N.º de documento 1000000109376 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Canal
Resultado
azul
1
Los grupos que presentan intensidad en los canales verde y
azul.
1
Los grupos que presentan intensidad solo en el canal azul.
0
Grupos que no presentan intensidad en una ubicación de
grupos conocida.
0
Los grupos que presentan intensidad solo en el canal verde.
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