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Guía del sistema de secuenciación NextSeq 2000
Inicio de un experimento de secuenciación
Este paso inicia un experimento de secuenciación en uno de los cuatro modos:
•
Modo Cloud (Nube): el experimento se selecciona de una lista de experimentos programados en
NextSeq 1000/2000 Control Software. Durante la secuenciación, los datos de cBCL se cargan en
BaseSpace Sequence Hub. Una vez finalizada la secuenciación, DRAGEN se inicia
automáticamente en BaseSpace Sequence Hub.
•
Modo Hybrid (Híbrido): el experimento se selecciona de una lista de experimentos programados
en NextSeq 1000/2000 Control Software. Tras finalizar la secuenciación, el análisis integrado en el
instrumento se inicia automáticamente. Los datos cBCL y los archivos de resultados del análisis
secundario de DRAGEN se almacenan en la carpeta de resultados seleccionada.
•
Modo Local: una hoja de muestras con el formato de archivo v2 se importa manualmente en
NextSeq 1000/2000 Control Software. Tras finalizar la secuenciación, el análisis integrado en el
instrumento se inicia automáticamente. Los datos cBCL y los archivos de resultados del análisis
secundario de DRAGEN se almacenan en la carpeta de resultados seleccionada. Si se selecciona
Proactive, Run Monitoring and Storage (Proactive, Supervisión del experimento y Almacenamiento),
el análisis también se puede iniciar mediante las aplicaciones de BaseSpace Sequence Hub una vez
finalizada la secuenciación.
•
Modo Standalone (Independiente): configure un experimento, siguiendo las instrucciones de
NextSeq 1000/2000 Control Software para generar los datos cBCL.
Si se abre el visor durante la comprobación previa al experimento o durante el experimento, se puede
producir un error en el experimento.
Mantenga las manos alejadas del instrumento durante la apertura y cierre del visor para evitar lesiones.
Inicio de un experimento Cloud (Nube) o Hybrid (Híbrido)
1.
Configure el modo de experimento, tal y como se describe en
experimento en la página
2.
Seleccione Start (Iniciar).
3.
Introduzca sus credenciales de inicio de sesión de BaseSpace Sequence Hub y, a continuación,
seleccione Sign In (Iniciar sesión).
4.
Si ha seleccionado Proactive, Run Monitoring and Storage (Proactive, Supervisión del experimento
y Almacenamiento), seleccione el grupo de trabajo que contiene el experimento creado en
Instrument RunSetup (Configuración del experimento en el instrumento) en BaseSpace Sequence
Hub.
Para evitar errores es necesario seleccionar un grupo de trabajo. Asegúrese de haber seleccionado un
grupo de trabajo antes de continuar.
5.
Seleccione Next (Siguiente).
6.
Seleccione su experimento.
7.
Confirme que la versión de Analysis (Análisis), Run Length (Longitud del experimento) y Secondary
Analysis (Análisis secundario) coincida con el experimento correcto.
El análisis muestra Cloud_ para indicar que este se realiza en BaseSpace Sequence Hub.
8.
Seleccione Review (Revisar).
N.º de documento 1000000109376 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
15.
Configuración del modo de
35
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