Tabla de contenido
Guía del sistema de secuenciación iSeq 100
Flujo de trabajo de análisis en tiempo real
Extracción de intensidad
Corrección de hebra
retrasada
Llamada de bases
Puntuación de calidad
Extracción de intensidad
La extracción de intensidad calcula un valor de intensidad para cada nanopocillo en una imagen
determinada.
Corrección de hebra retrasada
Durante la reacción de secuenciación, cada cadena de ADN de un grupo se amplía en una base por cada
ciclo. Las hebras retrasadas y hebras adelantadas se producen cuando una cadena queda fuera de su lugar
con respecto al ciclo de incorporación.
La hebra retrasada se produce cuando una base se atrasa.
u
La hebra adelantada se produce cuando una base se avanza.
u
Figura 9 Hebra retrasada y hebra adelantada
A Lectura con una base con hebra retrasada
B Lectura con una base con hebra adelantada
RTA2 corrige los efectos de la fase de hebra retrasada y de la fase de hebra adelantada, lo que aumenta al
máximo la calidad de los datos en cada uno de los ciclos del experimento.
Llamada de bases
La llamada de bases determina una base (A, C, G o T) para cada grupo de una placa determinada en un
ciclo específico. El sistema iSeq 100 utiliza la secuenciación con un solo colorante, lo que se traduce en el uso
de un solo colorante y dos imágenes para codificar los datos de las cuatro bases.
Las intensidades extraídas de una imagen en comparación con una segunda imagen redundan en cuatro
poblaciones distintas, cada una de las cuales corresponde a un nucleótido. La llamada de bases determina
a qué población pertenece cada grupo.
N.º de documento 1000000036024 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Determina un valor de intensidad para cada grupo.
Corrige los efectos de hebra retrasada y hebra adelantada.
Determina una llamada de bases para cada grupo.
Asigna una puntuación de calidad a cada llamada de bases.
45
Capítulos
Tabla de contenido
Solución de problemas
