Tabla de contenido
Guía del sistema de secuenciación NextSeq 2000
Componente
Salto de índices
Principales códigos de barras
desconocidos
Informe de estadísticas de demultiplexado
El informe de estadísticas de demultiplexado contiene información sobre el número de lecturas que
superan el filtro asignadas a cada muestra en la hoja de muestras. Todas las lecturas que no estén
claramente asociadas a una muestra se clasifican como indeterminadas. El informe también incluye
información sobre las puntuaciones de calidad de las bases en las lecturas que superan el filtro
asignadas a cada muestra.
Se incluye la siguiente información.
Criterio de medición
Lane
SampleID
Index
# Reads
# Perfect Index Reads
# One Mismatch Index
Reads
# of ≥ Q30 Bases (PF)
Mean Quality Score (PF)
N.º de documento 1000000109376 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Tipo
CSV
CSV
Descripción
El carril de la celda de flujo donde se ha secuenciado la muestra.
El ID de la muestra de la hoja de muestras. Si una lectura no se
corresponde con una muestra, el campo muestra undetermined (sin
determinar).
La concatenación de la lectura del índice 1 y de la lectura del índice 2
de la hoja de muestras se separan mediante un guion. Si una lectura no
se corresponde con una muestra, el campo muestra undetermined
(sin determinar).
El número de lecturas demultiplexadas que pasan el filtro para la
muestra del carril especificado.
Número de lecturas que coinciden perfectamente con las secuencias de
índices combinadas especificadas en la hoja de muestras.
Número de lecturas con un error en las secuencias de índices
combinadas especificadas en la hoja de muestras.
Número de bases, incluidos adaptadores, correspondientes a lecturas
que superan un umbral de calidad Q30.
La puntuación de calidad media de las lecturas correspondientes a la
muestra del carril especificado. El valor incluye bases de adaptador.
Nombre del archivo de resultados
•
Index_Hopping_Counts.csv
•
Top_Unknown_Barcodes.csv
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