Tabla de contenido
Guía del sistema de secuenciación NextSeq 2000
Figura 6
Visualización de intensidades de grupos
El color de cada grupo se correlaciona con los diagramas porcentaje de bases en Sequence
Analysis Viewer (SAV) y los datos del experimento de BaseSpace Sequence Hub por ciclo, no
se correlacionan con los canales verde y azul.
Grupos que superan el filtro
Durante el experimento, RTA3 filtra incidencias para eliminar las lecturas que no satisfagan el umbral
de calidad de los datos. Los grupos que se solapan o de baja calidad se eliminan.
En el caso del análisis de dos canales, RTA3 utiliza un sistema basado en la población para determinar
la castidad (medición de pureza de la intensidad) de una llamada de bases. Los grupos que superan el
filtro (PF) cuando solo una llamada de bases de los primeros 25 ciclos tiene un valor de castidad inferior
al umbral fijado. Si se incluye, la alineación de PhiX se lleva a cabo en el ciclo 26 en un subconjunto de
placas de grupos que superan el filtro. Los grupos que no superan el filtro no se alinean ni se realiza en
ellos la llamada de bases.
Puntuaciones de calidad
Una puntuación de calidad (puntuación Q) es una predicción de la probabilidad de obtener una llamada
de bases incorrecta. Una puntuación Q superior implica que la llamada de bases tiene una calidad
mayor y es más probable que sea correcta. Tras determinar la puntuación Q, los resultados se registran
en archivos de llamada de bases (*.cbcl).
La puntuación Q comunica brevemente pequeñas probabilidades de error. Las puntuaciones de calidad
se representan como Q(X), donde X es la puntuación. En la siguiente tabla, figura la relación entre una
puntuación de calidad y la probabilidad de error.
N.º de documento 1000000109376 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
45
Tabla de contenido
