Tabla de contenido
Guía del sistema de secuenciación NextSeq 2000
Ajuste
OverrideCycles
2.
Finalice la configuración del experimento.
•
Para enviar la configuración del experimento a su cuenta de BaseSpace Sequence Hub,
seleccione Submit Run (Enviar experimento). Los experimentos enviados a BaseSpace
Sequence Hub aparecen en la lista de experimentos planificados y están disponibles para
los sistemas utilizando el modo Cloud (Nube) o el modo Hybrid (Híbrido).
•
Para guardar la configuración del experimento como una hoja de muestras con formato de
archivo v2, seleccione Export Sample Sheet (Exportar hoja de muestras) en la lista
desplegable Submit Run (Enviar experimento). La hoja de muestras es necesaria para
iniciar experimentos en los sistemas utilizando el modo Local. Esta opción solo está
disponible si la ubicación del análisis seleccionada es Local.
Illumina DRAGEN Enrichment
Utilice los siguientes pasos para configurar el análisis Illumina DRAGEN Enrichment.
1.
Seleccione un genoma de referencia.
Si es posible, utilice un genoma de referencia con ALT-Aware.
2.
Seleccione un archivo *.bed que contenga las regiones a las que le gustaría dirigirse o cargue un
nuevo archivo personalizado.
Asegúrese de que el genoma de referencia del archivo BED coincide con el seleccionado en el paso
1. Si se trata de un nuevo archivo BED personalizado, utilice la siguiente nomenclatura: nombre_
del_panel_númerodeversión.genomadereferencia.bed.
•
Modo Local: seleccione Select Custom File (Local) (Seleccionar archivo personalizado
[Local]) para cargar un único experimento o Upload Custom File (BaseSpace) (Cargar
archivo personalizado [BaseSpace]) para un uso repetido.
•
Modo Cloud (Nube) o Hybrid (Híbrido): seleccione Upload Custom File (BaseSpace)
(Cargar archivo personalizado [BaseSpace]). El archivo BED personalizado solo está
disponible en el grupo de trabajo en el que se ha cargado.
3.
Seleccione un formato de resultados de asignación o alineación.
4.
Finalice la configuración del experimento.
•
Para enviar la configuración del experimento a su cuenta de BaseSpace Sequence Hub,
seleccione Submit Run (Enviar experimento). Los experimentos enviados a BaseSpace
Sequence Hub aparecen en la lista de experimentos planificados y están disponibles para
los sistemas utilizando el modo Cloud (Nube) o el modo Hybrid (Híbrido).
N.º de documento 1000000109376 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Descripción
Cadena utilizada para especificar ciclos UMI y desenmascarar
ciclos de una lectura. Se permiten los siguientes valores:
•
N: especifica los ciclos a ignorar.
•
Y: especifica los ciclos de secuenciación.
•
I: especifica los ciclos de indexado.
•
U: especifica los ciclos UMI a recortar.
Cada elemento se separa con punto y coma. A continuación, tiene
ejemplos de entradas de OverrideCycles.
U8Y143;I8;I8;U8Y143
N10Y66;I6;N10Y66
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