Tabla de contenido
Guía del sistema de secuenciación NextSeq 2000
Protocolo
Esta sección ofrece instrucciones paso a paso sobre cómo preparar consumibles, diluir bibliotecas y
configurar un experimento de secuenciación en uno de los cuatro modos de experimento (los modos
Cloud [Nube], Hybrid [Híbrido] y Local utilizan DRAGEN o aplicaciones de BaseSpace Sequence Hub,
mientras que el modo Standalone [Independiente] es un experimento independiente para generar
datos cBCL solo para flujos de trabajo de análisis personalizado).
Cuando manipule reactivos y otras sustancias químicas, utilice gafas de seguridad, una bata de
laboratorio y guantes sin talco.
Asegúrese de que cuenta con el equipo y los consumibles necesarios antes de iniciar un protocolo.
Consulte
Consumibles y
Siga los protocolos en el orden mostrado, con los volúmenes, las temperaturas y las duraciones que se
especifiquen.
Consideraciones de secuenciación
Antes de iniciar el protocolo, revise la siguiente información para preparar la dilución de las bibliotecas y
la configuración del experimento. Alcanzar la concentración de carga óptima es fundamental para una
secuenciación y un análisis correctos. Introducir el número correcto de ciclos en una lectura ayuda a
garantizar un rendimiento de datos óptimo.
Concentraciones y volumen de carga
El volumen de carga es de 20 µl. La concentración de carga varía en función del tipo de biblioteca:
Tipo de biblioteca
AmpliSeq™ for Illumina Library PLUS
Illumina DNA Prep
Illumina DNA Prep with Enrichment
100 % PhiX
TruSeq DNA Nano 350
TruSeq DNA Nano 550
TruSeq Stranded mRNA
En el caso de otros tipos de biblioteca, se recomienda una concentración de carga inicial de 650 pM.
Optimice esta concentración en los experimentos subsiguientes para identificar una concentración de
carga que produzca, de manera uniforme, datos que cumplan con las especificaciones.
La tasa del porcentaje de ocupación se puede observar en BaseSpace Sequence Hub e indica el
porcentaje de pocillos que contienen grupos. No utilice la tasa del porcentaje de ocupación para
optimizar la concentración de carga en NextSeq 2000.
N.º de documento 1000000109376 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
equipos.
Concentración de carga (pM)
750
750
1000
650
1200
1500
1000
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