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Guía del sistema de secuenciación NextSeq 2000
8.
[Opcional]
Para cambiar la carpeta de resultados, seleccione el campo Output Folder (Carpeta de
resultados) e introduzca una nueva ubicación.
El campo Output Folder (Carpeta de resultados) se rellena automáticamente a partir de la
configuración predeterminada y es obligatorio a menos que esté seleccionado Proactive, Run
Monitoring and Storage (Proactive, Supervisión del experimento y Almacenamiento).
Si ha seleccionado Proactive, Run Monitoring and Storage (Proactive, Supervisión del experimento y
Almacenamiento), Save to BaseSpace Sequence Hub (Guardar en BaseSpace Sequence Hub)
aparecerá como Enabled (Activado).
Si ha seleccionado Proactive and Run Monitoring (Proactive y Supervisión del experimento), Save to
BaseSpace Sequence Hub (Guardar en BaseSpace Sequence Hub) aparece como Disabled
(Desactivado).
Inicio de un experimento Standalone (Independiente)
1.
Configure el modo de experimento, tal y como se describe en
experimento en la página
2.
Seleccione Start (Iniciar).
3.
Si ha seleccionado Proactive, Run Monitoring and Storage (Proactive, Supervisión del experimento
y Almacenamiento), introduzca sus credenciales de inicio de sesión en BaseSpace Sequence Hub
y, a continuación, seleccione Sign In (Iniciar sesión).
4.
Si ha seleccionado Proactive, Run Monitoring and Storage (Proactive, Supervisión del experimento
y Almacenamiento), seleccione el grupo de trabajo de BaseSpace Sequence Hub donde guardar su
experimento y, a continuación, seleccione Next (Siguiente).
5.
Seleccione Set Up New Run (Configurar nuevo experimento).
6.
En el campo Run Name (Nombre del experimento), introduzca un nombre único de su preferencia
para identificar el experimento actual.
El nombre de experimento puede contener caracteres alfanuméricos, guiones medios, guiones y
guiones bajos.
7.
En Read Type (Tipo de lectura), seleccione el número de lecturas de secuenciación que se van a
realizar:
•
Single Read (Lectura única): realice una lectura, que es la opción más sencilla y rápida.
•
Paired-End: realice dos lecturas, cuyo consenso genera datos de alta calidad y le ofrece una
alineación más precisa.
8.
Introduzca el número de ciclos realizados en cada lectura:
No hay un número máximo de ciclos de índice, pero la suma de los ciclos de lectura y de los de
índice debe ser menor que el número de ciclos indicado en la etiqueta del cartucho más 27.
Read 1 (Lectura 1): introduzca un valor entre 1 y 151 ciclos.
Index 1 (Índice 1): introduzca el número de ciclos para el cebador del Índice 1 (i7). En el caso de un
experimento solo de PhiX, introduzca 0 en ambos campos de índice.
Index 2 (Índice 2): introduzca el número de ciclos para el cebador del Índice 2 (i5).
Read 2 (Lectura 2): introduzca como máximo 151 ciclos. Este valor suele ser el mismo que el valor de
Lectura 1.
9.
Si ha seleccionado Proactive, Run Monitoring and Storage (Proactive, Supervisión del experimento
y Almacenamiento), seleccione Choose... (Elegir...) para importar una hoja de muestras.
N.º de documento 1000000109376 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
15.
Configuración del modo de
37
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