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Guía del sistema de secuenciación NextSeq 2000
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Para guardar la configuración del experimento como una hoja de muestras con formato de
archivo v2, seleccione Export Sample Sheet (Exportar hoja de muestras) en la lista
desplegable Submit Run (Enviar experimento). La hoja de muestras y los archivos de
soporte del análisis secundario se descargan en una carpeta .zip y son necesarios para
iniciar experimentos en sistemas que utilizan el modo Local. Esta opción solo está
disponible si la ubicación del análisis seleccionada es Local.
Illumina DRAGEN Germline
Utilice los siguientes pasos para configurar el análisis Illumina DRAGEN Germline.
1.
Seleccione su genoma de referencia.
Si es posible, utilice un genoma de referencia con ALT-Aware.
2.
Seleccione un formato de resultados de asignación o alineación.
3.
Finalice la configuración del experimento.
•
Para enviar la configuración del experimento a su cuenta de BaseSpace Sequence Hub,
seleccione Submit Run (Enviar experimento). Los experimentos enviados a BaseSpace
Sequence Hub aparecen en la lista de experimentos planificados y están disponibles para
los sistemas utilizando el modo Cloud (Nube) o el modo Hybrid (Híbrido).
•
Para guardar la configuración del experimento como una hoja de muestras con formato de
archivo v2, seleccione Export Sample Sheet (Exportar hoja de muestras) en la lista
desplegable Submit Run (Enviar experimento). La hoja de muestras y los archivos de
soporte del análisis secundario se descargan en una carpeta .zip y son necesarios para
iniciar experimentos en sistemas que utilizan el modo Local. Esta opción solo está
disponible si la ubicación del análisis seleccionada es Local.
Illumina DRAGEN RNA
Utilice los siguientes pasos para configurar el análisis Illumina DRAGEN RNA.
1.
Seleccione su genoma de referencia.
Si es posible, utilice un genoma de referencia sin ALT-Aware.
2.
Seleccione su formato de resultados de asignación o alineación.
3.
[Opcional]
Cargue un archivo de anotación de ARN en Gene Transfer Format (Formato de
transferencia de genes, GTF).
•
Modo Local: seleccione Select Custom File (Local) (Seleccionar archivo personalizado
[Local]) para cargar un único experimento o Upload Custom File (BaseSpace) (Cargar
archivo personalizado [BaseSpace]) para un uso repetido.
•
Modo Cloud (Nube) o Hybrid (Híbrido): seleccione Upload Custom File (BaseSpace)
(Cargar archivo personalizado [BaseSpace]). El archivo GTF solo está disponible en el grupo
de trabajo en el que se ha cargado.
Una vez que se haya cargado un archivo GTF en un grupo de trabajo de BaseSpace Sequence Hub,
seleccione el archivo de anotación de ARN en el menú desplegable.
4.
Finalice la configuración del experimento.
•
Para enviar la configuración del experimento a su cuenta de BaseSpace Sequence Hub,
seleccione Submit Run (Enviar experimento). Los experimentos enviados a BaseSpace
Sequence Hub aparecen en la lista de experimentos planificados y están disponibles para
los sistemas utilizando el modo Cloud (Nube) o el modo Hybrid (Híbrido).
N.º de documento 1000000109376 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
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