Flujo De Trabajo De Análisis En Tiempo Real; Extracción De Intensidad; Corrección De Hebra Retrasada - Illumina NovaSeq 6000 Guia Del Usuario

Guía del sistema de secuenciación NovaSeq 6000
1, 2, 3, 4, 5 o 6 para una celda de flujo S4.
u
Los dos últimos dígitos representan el número de placa. La numeración comienza por 01 en el extremo
u
de salida de la celda de flujo hasta 88 o 78 en el extremo de entrada.
De 01 a 78 para una celda de flujo SP, S1 o S4.
u
De 01 a 88 para una celda de flujo S2.
u
Flujo de trabajo de análisis en tiempo real
Registro
Extracción de intensidad
Corrección de hebra
retrasada
Llamada de bases
Puntuación de calidad
Registro
El registro alinea una imagen con la matriz hexagonal de nanopocillos en la celda de flujo de tramas. Debido a
la disposición ordenada de los nanopocillos, las coordenadas X e Y para cada grupo de una placa son
predeterminadas. Las posiciones de los grupos se recopilan en un archivo de ubicación de grupos (s.locs)
para cada experimento.
Si se produce un error en el registro de cualquier imagen en un ciclo, no se generará ninguna llamada de
bases para esa placa en ese ciclo. Utilice el Visor del análisis de secuenciación para identificar qué imágenes
no se han podido registrar.
Extracción de intensidad
Tras el registro, la extracción de intensidad calcula un valor de intensidad para cada nanopocillo en una
imagen determinada. Si el registro falla, no es posible extraer la intensidad para dicha placa.
Corrección de hebra retrasada
Durante la reacción de secuenciación, cada cadena de ADN de un grupo se amplía en una base por cada
ciclo. Las hebras retrasadas y hebras adelantadas se producen cuando una cadena queda fuera de su lugar
con respecto al ciclo de incorporación.
La hebra retrasada se produce cuando una base se atrasa.
u
La hebra adelantada se produce cuando una base se avanza.
u
N.º de documento 1000000019358 v11 ESP N.º de material 20023471
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Registra la ubicación de cada grupo en la celda de flujo de tramas.
Determina un valor de intensidad para cada grupo.
Corrige los efectos de hebra retrasada y hebra adelantada.
Determina una llamada de bases para cada grupo.
Asigna una puntuación de calidad a cada llamada de bases.
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