Tabla de contenido
Guía del sistema de secuenciación NextSeq 2000
Campo
Necesario
Read1Cycles
Sí
Read2Cycles
No
Index1Cycles
No
Index2Cycles
No
Requisitos de BCL Convert (Conversión de BCL)
Las secciones BCL Convert (Conversión de BCL) ofrecen información para convertir los datos de BCL a
FASTQ. Las opciones de BCL Convert (Conversión de BCL) incluyen dos secciones independientes:
[BCLConvert_Settings] y [BCLConvert_Data]. Las secciones BCL Convert (Conversión de BCL)
requieren información sobre las secuencias del adaptador de índices. Para identificar la secuencia del
adaptador compatible para cada lectura e índice, consulte Secuencias de adaptadores de Illumina (n.º
de documento 1000000002694).
Estos son los campos y descripciones de [BCLConvert_Settings] disponibles.
Campo
SoftwareVersion
BarcodeMistmatchesIndex1
BarcodeMismatchesIndex2
AdapterRead1
AdapterRead2
N.º de documento 1000000109376 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Descripción
Número de ciclos de la primera lectura. El valor debe ser un
número entero mayor que cero.
Número de ciclos de la segunda lectura.
Número de ciclos de la primera lectura del índice. Obligatorio
cuando se secuencia más de una muestra. El máximo es de
10 ciclos.
Número de ciclos de la segunda lectura del índice. El máximo es
de 10 ciclos.
Necesario
Descripción
Sí
La versión del software DRAGEN instalada actualmente
en el sistema. Utilice los tres números enteros incluidos
en el nombre de la versión. Por ejemplo, 3.5.7.
No
El número de incoherencias permitidas entre la primera
lectura del índice y la secuencia de índice. Los valores
pueden ser 0, 1 o 2. El valor predeterminado es 1.
No
El número de incoherencias permitidas entre la segunda
lectura del índice y la secuencia de índice. Los valores
pueden ser 0, 1 o 2. El valor predeterminado es 1.
No
La secuencia que se recortará o enmascarará desde el
final de Lectura 1. Secuencia del adaptador de Lectura 1
que contiene A, C, G o T. AdapterRead1 recorta los
ciclos de manera predeterminada.
No
La secuencia que se recortará o enmascarará desde el
final de Lectura 2. Secuencia del adaptador de Lectura 2
que contiene A, C, G o T. AdapterRead2 recorta los
ciclos de manera predeterminada.
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