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Guía del sistema de secuenciación NextSeq 2000
Requisitos del proceso DRAGEN RNA
Estos son los campos y descripciones de [DragenRNA_Settings] disponibles.
Campo
SoftwareVersion
ReferenceGenomeDir
RNAGeneAnnotationFile
MapAlignOutFormat
Estos son los campos y descripciones de [DragenRna_Data] disponibles.
Campo
Sample_ID
N.º de documento 1000000109376 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Necesario
Descripción
Sí
La versión del software DRAGEN instalada actualmente
en el sistema. Utilice los tres números enteros incluidos
en el nombre de la versión. Por ejemplo, 3.5.7.
La versión del software debe coincidir con la versión
especificada en la sección BCLConvert_Settings.
Sí
El nombre del genoma de referencia. Por ejemplo, hg38_
noalt_with_decoy. Utilice el nombre del genoma de
referencia de /usr/local/illumina/genomes. Para
utilizar un genoma de referencia personalizado, consulte la
Ayuda en línea de la aplicación Reference Builder para
Illumina Instruments v1.0.0 e
referencia personalizados en la página
No
El archivo que contiene anotaciones genéticas de ARN.
Solo se permiten caracteres alfanuméricos. Si no se
suministra, se utiliza el archivo de anotaciones
predeterminado incluido en el genoma de referencia
especificado.
No
El formato del archivo de resultados. Los valores
permitidos son bam o cram. Si no se especifica ningún
valor, no hay ningún valor predeterminado.
Necesario
Descripción
Sí
ID de la muestra. El ID de muestra puede contener un máximo
de 20 caracteres alfanuméricos. El ID distingue entre
mayúsculas y minúsculas. Separe cada identificador con un
guion. Por ejemplo, Muestra1-DQB1-022515. Los ID de
muestra deben coincidir con los ID especificados en la sección
BCLConvert_Data.
Importación de genomas de
14.
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