Llamada De Bases - Illumina NovaSeq 6000 Guia Del Usuario

Guía del sistema de secuenciación NovaSeq 6000
Figura 31 Hebra retrasada y hebra adelantada
A Lectura con una base con hebra retrasada
B Lectura con una base con hebra adelantada
RTA3 corrige los efectos de la hebra retrasada y adelantada, lo que aumenta al máximo la calidad de los
datos en cada uno de los ciclos del experimento.

Llamada de bases

La llamada de bases determina una base (A, C, G o T) para cada grupo de una placa determinada en un
ciclo específico. El sistema de secuenciación NovaSeq 6000 utiliza secuenciación de dos canales, que
precisa solo dos imágenes para codificar los datos de cuatro bases de ADN, una del canal rojo y una del
canal verde.
Una ausencia de llamada se identifica como N. La ausencia de llamadas se produce cuando un grupo no
supera el filtro, el registro falla o se desplaza un grupo fuera de la imagen.
Las intensidades de cada grupo se extraen de la imagen roja y de la verde y se comparan una con otra, lo
que produce cuatro poblaciones diferenciadas. Cada población se corresponde con una base. El proceso
de llamada de bases determina a qué población pertenece cada grupo.
Figura 32 Visualización de intensidades de grupos
Tabla 22 Llamada de bases en secuenciación de dos canales
Base Canal rojo
A 1 (encendido)
C 1 (encendido)
N.º de documento 1000000019358 v11 ESP N.º de material 20023471
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Canal verde Resultado
1 (encendido) Los grupos que presentan intensidad en el canal rojo y
verde.
0 (apagado) Los grupos que presentan intensidad solo en el canal rojo.
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