Apéndice C Archivos Y Carpetas De Resultados; Archivos De Resultados De Secuenciación; Placas De La Celda De Flujo - Illumina NextSeq550Dx Guía De Referencia

Apéndice C Archivos y carpetas de resultados
Archivos de resultados de secuenciación
Estructura de carpetas de resultados de secuenciación
Archivos de resultados de lectura
Estructura de carpetas de resultados de lectura
Archivos de resultados de secuenciación
Tipos de archivo Descripción, ubicación y nombre del archivo
Archivos de llamada Cada placa analizada se incluye en un archivo de llamadas de bases, agregado en un archivo
de bases para cada carril y para cada ciclo. El archivo agregado contiene la llamada de bases y la
puntuación de calidad codificada para cada grupo en ese carril.
Data\Intensities\BaseCalls\L00[X]: Los archivos se almacenan en una carpeta para cada carril.
[Ciclo].bcl.bgzf, donde [Ciclo] representa el número de ciclo en cuatro dígitos. Los archivos de
llamadas de bases se comprimen mediante el uso de la compresión de bloques gzip.
Archivo de índice de Para cada carril, un archivo de índice binario recopila la información de placas original en un
llamadas de bases par de valores para cada placa, que son el número de placa y el número de grupos para la
placa.
Los archivos de índice de llamadas de bases se generan al crear por primera vez un archivo de
llamadas de bases para ese carril.
Data\Intensities\BaseCalls\L00[X]: Los archivos se almacenan en una carpeta para cada carril.
s_[Carril].bci
Archivos de Para cada placa, las coordenadas X e Y para cada grupo se agregan a un archivo de
ubicación de grupos ubicación de grupos para cada carril. Los archivos de ubicación de grupos son el resultado de
la generación de plantillas.
Data\Intensities\L00[X]: Los archivos se almacenan en una carpeta para cada carril.
s_[carril].locs
Archivos de filtro El archivo de filtro especifica si los grupos han superado los filtros. La información de filtro se
agrega a un archivo de filtro para cada carril y lectura.
Estos archivos se generan en el ciclo 26 mediante el uso de 25 ciclos de datos.
Data\Intensities\BaseCalls\L00[X]: Los archivos se almacenan en una carpeta para cada carril.
s_[carril].filter
Archivos InterOp Archivos de informes binarios utilizados por Sequencing Analysis Viewer (SAV). Los archivos
InterOp se actualizan durante el experimento.
Carpeta InterOp
Archivo de Creado al inicio del experimento, el archivo de configuración de RTA contiene los parámetros
configuración de de configuración del experimento.
[Carpeta raíz], RTAConfiguration.xml
RTA
Archivo de Indica el nombre del experimento, el número de ciclos de cada lectura, si es una lectura
información del indexada y el número de sectores y placas de la celda de flujo. El archivo de información del
experimento experimento se crea al inicio del experimento.
[Carpeta raíz], RunInfo.xml

Placas de la celda de flujo

Las placas son pequeñas áreas de adquisición de imágenes en la celda de flujo definidas como el campo de
visión por la cámara. El número total de placas depende del número de imágenes de carriles, sectores y
superficies adquiridas en la celda de flujo, así como del funcionamiento conjunto de las cámaras para la
obtención de las imágenes. Las celdas de flujo de alto rendimiento cuentan con un total de 864 placas.
N.º de documento 1000000041922 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
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