Archivos De Solución De Problemas Para Las Lecturas De Matrices; Solución De Errores De La Comprobación Automática; Comprobaciones Para Los Experimentos De Secuenciación - Illumina NextSeq550Dx Guía De Referencia

Guía de referencia del modo de investigación del instrumento NextSeq 550Dx
Archivo clave
Archivos de registro
Archivos de registro de
errores (*ErrorLog*.txt)
Archivos de registro
global
(*GlobalLog*.tsv)
Errores de RTA
Para solucionar los errores de RTA, compruebe primero el registro de errores de RTA que se almacena en la
carpeta RTALogs (Registros de RTA). Este archivo no está presente para los experimentos realizados con
éxito. Incluya el registro de errores al notificar los problemas al servicio de asistencia técnica de Illumina.
Archivos de solución de problemas para las lecturas de matrices
Archivo clave Carpeta
Archivo de parámetros Carpeta
de la lectura raíz
(ScanParameters.xml)
Archivos de registro Logs
(Registros)
Archivos de criterios [Código
de medición de barras]
Archivo de relectura [Código
de barras]
Solución de errores de la comprobación automática
Si se producen errores durante la comprobación automática, lleve a cabo las medidas recomendadas que
se indican a continuación para solucionar el error. Las comprobaciones automáticas son distintas para la
secuenciación y para las lecturas de matrices.
Comprobaciones para los experimentos de secuenciación
Si falla una comprobación previa al experimento, la identificación de radiofrecuencia (RFID) del cartucho de
reactivo no está bloqueada y puede usarse en un experimento posterior. Sin embargo, la RFID se bloquea
después de que se hayan perforado los cierres metálicos.
N.º de documento 1000000041922 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Carpeta Descripción
Logs Los archivos de registro describen cada paso llevado a cabo por el instrumento
(Registros) en cada ciclo y enumeran las versiones de software y firmware utilizadas con el
experimento. El archivo llamado [NombreDelInstrumento]_CurrentHardware.csv
muestra los números de serie de los componentes del instrumento.
RTA logs Registro de errores de RTA.
Los archivos de registro de errores se actualizan siempre que se produce un
(Registros
error.
de RTA)
RTA logs Registro de todos los eventos de RTA.
Los archivos de registro global se actualizan durante el experimento.
(Registros
de RTA)
Descripción
Contiene información sobre los parámetros de la lectura. La información incluye la
fecha de lectura, el código de barras del BeadChip, la ubicación del archivo de grupos
y la ubicación del archivo de manifiesto.
Los archivos de registro describen todos los pasos llevados a cabo en el instrumento
durante la lectura.
Los criterios de medición se proporcionan como criterios de medición de la muestra y
como criterios de medición de la sección.
[código de barras]_sample_metrics.csv: Para cada muestra y canal (rojo y verde),
recoge Percent Off Image (Porcentaje fuera de imagen), Percent Outliers (Porcentaje
de valores atípicos), P05, P50, P95, Avg FWHM Avg (Prom. FWHM medio), FWHM
Stddev (desviación estándar de FWHM) y Min Registration Score (Puntuación mínima
de registro).
[código de barras]_section_metrics.csv: Para cada sección y placa, recoge Laser Z-
position (Posición Z del láser), Through Focus Z-position (Posición de Z a través del
enfoque), Red FWHM (FWHM rojo), Green FWHM (FWHM verde), Red Avg Pixel
Intensity (Intensidad media de píxeles rojos), Green Avg Pixel Intensity (Intensidad
media de píxeles verdes), Red Registration Score (Puntuación de registro rojo) y Green
Registration Score (Puntuación de registro verde).
[código de barras]_rescan.flowcell: Recoge las ubicaciones de placas ajustadas para
una relectura, que incluyen un solapamiento de placa a placa progresivo.
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