Archivos De Resultados De Lectura; Estructura De Carpetas De Resultados De Lectura - Illumina NextSeq550Dx Guía De Referencia

Guía de referencia del modo de investigación del instrumento NextSeq 550Dx
RTALogs (Registros de RTA): archivos de registro que describen los pasos del análisis.
RTAConfiguration.txt
RunInfo.xml
RunNotes.xml
RunParameters.xml

Archivos de resultados de lectura

Tipos de archivo
Archivos GTC
Archivos de imagen

Estructura de carpetas de resultados de lectura

[Fecha]_[Nombre de instrumento]_[N.º de lectura]_[Código de barras]
[Código de barras]
Config (Configuración)
Effective.cfg: registra los ajustes de configuración utilizados durante la lectura.
Focus (Enfoque): contiene archivos de imagen usados para enfocar la lectura.
Logs (Registros): contiene archivos de registro en los que se recogen todos los pasos llevados a
cabo durante la lectura.
PreScanDiagnosticFiles (Archivos de diagnóstico previo a la lectura)
[Fecha_Hora] Barcode Scan (Lectura de código de barras)
ProcessedBarcode.jpg: imagen del código de barras del BeadChip.
Diagnóstico de lectura (archivos de registro)
PreScanChecks.csv: registra los resultados de la comprobación automática.
N.º de documento 1000000041922 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Descripción, ubicación y nombre del archivo
Archivo de llamada de genotipo. Se genera un archivo GTC para cada muestra que se
escanea en el BeadChip. En el nombre del archivo, se incluye el código de barras y la
muestra escaneada.
[código de barras]_[muestra].gtc
Los archivos de imagen se nombran de acuerdo con el área escaneada del BeadChip.
En el nombre, se incluye el código de barras, la muestra y la sección en el BeadChip, el
sector y el canal de adquisición de imágenes (rojo o verde).
[código de barras]_[muestra]_[sección]_[sector]_[cámara]_[placa]_[canal].jpg
• Código de barras: El nombre de archivo comienza con el código de barras del
BeadChip.
• Muestra: Un área del BeadChip, numerada como fila (R0X) de arriba abajo y columna
(C0X) de izquierda a derecha.
• Sección: Fila numerada dentro de una muestra.
• Sector: Las imágenes de los BeadChips se adquieren en forma de grupo de placas
superpuestas. Por tanto, para adquirir la imagen de la sección solo se utiliza un sector.
• Cámara: La cámara empleada para capturar la imagen.
• Placa: Un área de adquisición de imágenes definida como campo de visión por la
cámara.
• Canal: Un canal es verde o rojo.
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