Flujo De Trabajo De La Rehibridación; Puntos Para Finalizar Un Experimento De Rehibridación - Illumina NextSeq550Dx Guía De Referencia

Guía de referencia del modo de investigación del instrumento NextSeq 550Dx
Cuando se pausa el experimento, se abre un cuadro de diálogo con opciones para levantar los
dispensadores y vaciar el contenedor lleno.
Vaciado del contenedor de reactivos usados
1 Seleccione Raise Sippers (Levantar dispensadores).
2 Extraiga el contenedor de reactivos usados y deseche el contenido de manera adecuada.
3 Vuelva a colocar el contenedor vacío en el compartimento de tampones.
4 Seleccione Continue (Continuar). El experimento se reanuda automáticamente.
Flujo de trabajo de la rehibridación
Es posible que se deba realizar un experimento de rehibridación si los criterios de medición generados
durante los primeros ciclos muestran intensidades por debajo de 2500. Algunas bibliotecas con poca
diversidad pueden mostrar intensidades por debajo de 1000, lo que es previsible y no se puede resolver con
la rehibridación.
NOTA
El comando End Run (Finalizar experimento) es definitivo. No es posible reanudar el experimento, no se
pueden reutilizar los consumibles del experimento y tampoco se guardan los datos de secuenciación del
experimento.
Cuando el usuario finaliza un experimento, el software lleva a cabo los pasos siguientes antes de que el
experimento termine:
Coloca la celda de flujo en un estado seguro.
u
Desbloquea la RFID de la celda de flujo para un experimento posterior.
u
Asigna una fecha de caducidad de rehibridación a la celda de flujo.
u
Escribe los registros del experimento para los ciclos realizados. Suele producirse un retraso.
u
Omite el lavado automático posterior al experimento.
u
Cuando inicie un experimento de rehibridación, el software realizará los pasos siguientes para llevar a cabo el
experimento:
Crea una carpeta de experimento con un nombre basado en un nombre único del experimento.
u
Comprueba que la fecha de rehibridación de la celda de flujo no haya caducado.
u
Ceba los reactivos. Suele producirse un retraso.
u
Se salta el paso de generación de grupos.
u
Elimina el cebador de lectura 1 anterior.
u
Hibrida un cebador de lectura 1 nuevo.
u
Continúa con la lectura 1 y el resto del experimento según los parámetros del experimento especificados.
u
Puntos para finalizar un experimento de rehibridación
La posterior rehibridación solo es posible si finaliza el experimento en los puntos siguientes:
Después del ciclo 5: las intensidades aparecen tras el registro de la cadena molde, para lo que son
u
necesarios los primeros cinco ciclos de secuenciación. Aunque es seguro finalizar un experimento
después del ciclo 1, se recomienda finalizarlo después del ciclo 5. No finalice un experimento durante la
generación de grupos.
N.º de documento 1000000041922 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
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