Apéndice C Archivos Y Carpetas De Resultados; Archivos De Resultados De Secuenciación - Illumina NextSeq 550 Guía Del Sistema

Apéndice C Archivos y carpetas de resultados
Archivos de resultados de secuenciación
Estructura de carpetas de resultados de secuenciación
Archivos de resultados de lectura
Estructura de carpetas de resultados de lectura
Archivos de resultados de secuenciación
Tipos de archivo Descripción, ubicación y nombre del archivo
Archivos de llamada Cada placa analizada se incluye en un archivo de llamada de bases, agregado en un archivo para
de bases cada carril y para cada ciclo. El archivo agregado contiene la llamada de bases y la puntuación de
calidad codificada para cada grupo en ese carril.
Data\Intensities\BaseCalls\L00[X]: los archivos se almacenan en una carpeta para cada carril.
[Ciclo].bcl.bgzf, donde [Ciclo] representa el número de ciclo de cuatro dígitos. Los archivos de
llamadas de bases se comprimen mediante el uso de la compresión de bloques gzip.
Archivo de índice de Para cada carril, un archivo de índice binario recopila la información de placas original en un par de
llamadas de bases valores para cada placa, que son el número de placa y el número de grupos para la placa.
Los archivos de índice de llamadas de bases se generan al crear por primera vez un archivo de
llamadas de bases para ese carril.
Data\Intensities\BaseCalls\L00[X]: los archivos se almacenan en una carpeta para cada carril.
s_[Carril].bci
Archivos de ubicación Para cada placa, las coordenadas X e Y para cada grupo se agregan a un archivo de ubicación de
de grupos grupos para cada carril. Los archivos de ubicación de grupos son el resultado de la generación de
plantillas.
Data\Intensities\L00[X]: los archivos se almacenan en una carpeta para cada carril.
s_[carril].locs
Archivos de filtro El archivo de filtro especifica si los grupos han superado los filtros. La información de filtro se añade
a un archivo de filtro para cada carril y lectura.
Estos archivos se generan en el ciclo 26 mediante el uso de 25 ciclos de datos.
Data\Intensities\BaseCalls\L00[X]: los archivos se almacenan en una carpeta para cada carril.
s_[carril].filter
Archivos InterOp Archivos de informes binarios utilizados por Sequencing Analysis Viewer (SAV). Los archivos InterOp
se actualizan durante el experimento.
Carpeta InterOp
Archivo de Creado al inicio del experimento, el archivo de configuración de RTA contiene los parámetros de
configuración de RTA configuración del experimento.
[Carpeta raíz],
Archivo de Indica el nombre del experimento, el número de ciclos de cada lectura, si es una lectura indexada y
información del el número de sectores y placas de la celda de flujo. El archivo de información del experimento se
experimento crea al inicio del experimento.
[Carpeta raíz],
Archivos de vistas en Una imagen en miniatura para cada canal de color (rojo y verde) para las placas 1, 6 y 12 de todas
miniatura las cámaras, superficies superiores e inferiores, en cada ciclo durante la adquisición de imágenes.
Thumbnail_Images\L00[X]\C[X.1]: los archivos se almacenan en una carpeta para cada carril y una
subcarpeta para cada ciclo.
s_[carril]_[placa]_[canal].jpg: en el nombre de archivo, la placa se representa con un número de
cinco dígitos que indica la superficie, el sector, la cámara y la placa. Si desea obtener más
información, consulte
en miniatura en la página
N.º de documento 15069765 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
RTAConfiguration.xml
RunInfo.xml
Numeración de placas en la página 67
68.
y Asignación de nombre a imágenes
65
69
70
70
65