Illumina NovaSeq 6000 Guia Del Usuario página 35

Guía del sistema de secuenciación NovaSeq 6000
Configurar BaseSpace Sequence Hub
Lleve a cabo las siguientes instrucciones para configurar los ajustes predeterminados para BaseSpace
Sequence Hub. Durante la configuración del experimento, puede deshabilitar BaseSpace Sequence Hub
para el experimento actual o cambiar los ajustes para la supervisión y el almacenamiento del experimento.
Para conectar con BaseSpace Sequence Hub hace falta una conexión a Internet.
1 En el menú principal, seleccione Settings (Configuración).
La pantalla Settings (Configuración) se abre en la ficha Mode Selection (Selección de modo).
2 Seleccione la casilla de verificación BaseSpace Sequence Hub.
3 Seleccione una opción de configuración:
Run Monitoring and Storage (Almacenamiento y supervisión de experimentos): Envía los datos del
u
experimento a BaseSpace Sequence Hub para la supervisión remota y el análisis de los datos. Esta
opción precisa la carga de una hoja de muestras con el experimento.
Run Monitoring Only (Solo supervisión de experimentos): Envía los archivos del experimento InterOp,
u
de registro y otros archivos que no sean CBCL a BaseSpace Sequence Hub de forma que los
experimentos se puedan supervisar de manera remota.
4 En el menú desplegable Hosting Location (Ubicación de alojamiento), seleccione EU (Frankfurt) (UE
[Fráncfort]) o USA (N. Virginia) (EE. UU. [N. Virginia]).
Esta opción determina la ubicación de carga de los datos.
5 Si está suscrito a BaseSpace Enterprise:
a Seleccione la casilla de verificación Private Domain (Dominio privado).
b Introduzca el nombre del dominio utilizado para el inicio de sesión individual en BaseSpace
Sequence Hub.
6 Seleccione Save (Guardar).
Nombre de la hoja de muestras
Al ejecutar el NVCS v1.3.1 o anterior, debe darse el nombre de SampleSheet.csv (con distinción entre
mayúsculas y minúsculas) a una hoja de muestras utilizada para un experimento de NovaSeq 6000 y cargada
en BaseSpace Sequence Hub. Si la hoja de muestras tiene un nombre incorrecto y está habilitada la
supervisión y el almacenamiento del experimento, BaseSpace Sequence Hub marca el experimento con una
advertencia. Un experimento marcado se puede poner en cola para generación de FASTQ al seleccionar
More | Fix Sample Sheet and Requeue (Más | Solucionar hoja de muestras y volver a poner en cola) y luego
introducir la hoja de muestras adecuada. Hasta que se proporcione la hoja de muestras, los datos de
secuenciación no se pueden convertir en archivos de FASTQ.
Si ejecuta el NVCS v1.4 o posterior, no hay limitaciones en los nombres de la hoja de muestras.
Si utiliza el bcl2fastq2 Conversion Software v2.19 o posterior, para convertir datos a archivos FASTQ
localmente, puede usar la opción de línea de comandos --sample-sheet para especificar un archivo CSV
en cualquier ubicación. La línea de comandos permite el uso de cualquier nombre de archivo.
N.º de documento 1000000019358 v11 ESP N.º de material 20023471
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
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