Introducir Parámetros Del Experimento - Illumina NovaSeq 6000 Guia Del Usuario

Guía del sistema de secuenciación NovaSeq 6000
Para deshabilitar BaseSpace Sequence Hub, desmarque la casilla de verificación BaseSpace
u
Sequence Hub y, a continuación, seleccione Run Setup (Configuración del experimento) para
continuar sin iniciar sesión.
Para enviar los datos del experimento a BaseSpace Sequence Hub para la supervisión remota y el
u
análisis de los datos, seleccione Run Monitoring and Storage (Almacenamiento y supervisión de
experimentos). Para esta opción hace falta una hoja de muestras.
Para enviar archivos InterOp, runinfo.xml y runParameters.xml a BaseSpace Sequence Hub para
u
supervisar el experimento de manera remota, seleccione Run Monitoring Only (Solo supervisión de
experimentos).
2 Introduzca el nombre de usuario y la contraseña de BaseSpace Sequence Hub y, a continuación,
seleccione Sign In (Iniciar sesión).
3 Si se le solicita, seleccione un grupo de trabajo en el que cargar los datos del experimento y, a
continuación, seleccione Run Setup (Configuración del experimento).
Se le solicitará solo si pertenece a varios grupos de trabajo.
Introducir parámetros del experimento
1 Si el flujo de trabajo de NovaSeq Xp está activado, seleccione un tipo de flujo de trabajo.
Si selecciona NovaSeq Xp, asegúrese de que hay cargado un tubo de bibliotecas vacío.
u
Si selecciona NovaSeq Standard, asegúrese de que la muestra está cargada en el tubo de
u
bibliotecas.
2 En el campo Run Name (Nombre del experimento), introduzca un nombre de su preferencia para
identificar el experimento actual.
El nombre de experimento puede contener caracteres alfanuméricos, guiones y guiones bajos.
3 Introduzca el número de ciclos de cada lectura y la longitud del índice en el experimento de
secuenciación.
No existe un número máximo de ciclos de índices, pero la suma de los ciclos de lectura y los ciclos de
índices debe ser inferior al número de ciclos para el kit.
Read 1 (Lectura 1): Introduzca un valor de hasta 151 ciclos para kits de 300 ciclos, o de hasta 251
u
para kits de 500 ciclos.
Index 1 (Índice 1): Introduzca el número de ciclos para el cebador del índice 1 (i7).
u
Index 2 (Índice 2): Introduzca el número de ciclos para el cebador del índice 2 (i5).
u
Read 2 (Lectura 1): Introduzca un valor de hasta 151 ciclos para kits de 300 ciclos, o de hasta 251
u
para kits de 500 ciclos. Este valor suele ser el mismo que el valor de lectura 1.
NOTA
El número de ciclos analizados en las lecturas 1 y 2 es un ciclo menos que el valor introducido. Por ejemplo,
para llevar a cabo un experimento "paired-end" de 150 ciclos (experimento de 2 × 150 pb), introduzca el
valor de 151 ciclos para la lectura 1 y la lectura 2.
La suma de los cuatro valores introducidos puede superar el número indicado de ciclos para cada kit de
reactivos seleccionado en hasta 23 ciclos para experimentos "paired-end" y en 30 ciclos para experimentos
de lectura individual.
4 Amplíe la opción Advanced Options (Opciones avanzadas) para aplicar la configuración del experimento
actual.
Estos ajustes son opcionales a menos que se especifique lo contrario.
N.º de documento 1000000019358 v11 ESP N.º de material 20023471
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
55