Archivos De Resultados De Secuenciación - Illumina NovaSeq 6000 Guia Del Usuario

Guía del sistema de secuenciación NovaSeq 6000
Archivos de resultados de secuenciación
Tipos de archivo
Archivos de llamada de
bases
Archivos de ubicación de
grupos
Archivos de filtro
Archivos InterOp
Archivo de información
del experimento
Archivos de vistas en
miniatura
N.º de documento 1000000019358 v11 ESP N.º de material 20023471
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Descripción, ubicación y nombre del archivo
Cada grupo analizado se incluye en un archivo de llamadas de bases, agregado en un archivo
para cada ciclo, carril y superficie. El archivo agregado contiene la llamada de bases y la
puntuación de calidad codificada para cada grupo. Los archivos de llamada de bases se utilizan
con BaseSpace Sequence Hub o bcl2fastq2.
Data\Intensities\BaseCalls\L001\C1.1
L[carril]_[superficie].cbcl, por ejemplo, L001_1.cbcl
Para cada celda de flujo, un archivo binario de ubicación de grupos contiene las coordenadas X
e Y para los grupos en una placa. Una disposición hexagonal que coincide con la disposición de
nanopocillos de la celda de flujo define previamente las coordenadas.
Data\Intensities
s_[carril].locs
El archivo de filtro especifica si los grupos han superado los filtros. Estos archivos se generan en
el ciclo 26 mediante el uso de 25 ciclos de datos. Para cada placa, se genera un archivo de
filtro.
Data\Intensities\BaseCalls\L001
s_[carril]_[placa].filter
Archivos binarios de informes utilizados por el Visor del análisis de secuenciación. Los archivos
InterOp se actualizan durante el experimento.
Carpeta InterOp
Indica el nombre del experimento, el número de ciclos de cada lectura, si la lectura es una
Lectura del índice, y el número de sectores y placas de la celda de flujo. El archivo de
información del experimento se crea al inicio del experimento.
[Carpeta raíz], RunInfo.xml
Si se activa, aparece una imagen en miniatura cada 10 placas en cada canal de color (rojo y
verde).
Thumbnail_Images\L001\C[X.1]: Los archivos se almacenan en una subcarpeta para cada ciclo.
s_[carril]_[placa]_[canal].jpg: La imagen en miniatura incluye el número de placa.
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