Tabla de contenido
Capítulo 4 Secuenciación en el modo
TruSeq v3
Introducción
Para llevar a cabo un experimento de secuenciación en el modo TruSeq v3 en HiSeq 2000, prepare los
reactivos SBS para la Lectura 1 y los reactivos de indexado antes de configurar el experimento. Siga las
indicaciones del software para configurar el experimento. La configuración del experimento incluye la
introducción de los parámetros del experimento, la carga y el cebado de reactivos, la carga de la celda de
flujo y la realización de una comprobación de fluídica. Tras finalizar la Lectura 1 y cualquier lectura del índice,
prepare y cargue los reactivos SBS y "paired-end" para la Lectura 2.
Visite la página de especificaciones de HiSeq 2000 en el sitio web de Illumina para obtener información sobre
la duración del experimento y otras especificaciones de rendimiento.
Estratificación de experimentos
Puede iniciar un nuevo experimento en la celda de flujo A o en la celda de flujo B si hay un experimento en
curso en la celda de flujo adyacente. Para obtener más información, consulte
experimentos en la celda de flujo A y la celda de flujo B en la página
Tipos de experimentos para química de TruSeq v3
En la siguiente tabla se muestran los tipos de experimentos de secuenciación y el número de ciclos posibles
para cada lectura cuando se utiliza la química de TruSeq v3. Haga referencia a esta información cuando
configure el experimento.
Tipo de experimento
Single-Read (Lectura individual),
no indexada
Single-Read (Lectura individual),
de un solo índice
Single-Read (Lectura individual),
de doble índice
"Paired-end",
no indexada
"Paired-end",
de un solo índice
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Ciclos de
Ciclos de
Lectura 1
lectura de
Índice 1 (i7)
≤ 101
--
≤ 101
6 o 7 ¹
8 ²
≤ 101
8
≤ 101
--
≤ 101
7 ¹
8 ²
Escalonamiento de
59.
Ciclos de
Ciclos de
lectura de
Lectura 2
Índice 2 (i5)
--
--
--
--
8
--
--
≤ 101
--
≤ 101
29
30
31
35
38
42
45
46
49
49
Ciclos
totales
≤ 101
≤ 108 ¹
≤ 109 ²
≤ 117
≤ 202
≤ 209 ¹
≤ 210 ²
29
Capítulos
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