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Guía del sistema HiSeq 2000
Los archivos de resultados principales se utilizan para los análisis de datos posteriores. Utilice bcl2fastq para
la demultiplexación y la conversión de los archivos .bcl en archivos FASTQ, que se pueden utilizar como
entrada para la alineación. Para convertir datos procedentes del sistema HiSeq, utilice el software bcl2fastq
1.8.4 o una versión posterior.
RTA proporciona criterios de medición en tiempo real sobre la calidad del experimento almacenados como
archivos InterOp. Los archivos InterOp son archivos binarios que contienen criterios de medición
relacionados con placas, ciclos y lecturas, y son necesarios para la visualización de criterios de medición en
Sequencing Analysis Viewer (SAV). Para ver los criterios de medición generados por RTA, utilice SAV v1.8.20
o una versión posterior.
Para obtener información detallada sobre cada archivo de resultados, consulte
secuenciación en la página
Gestión de errores
RTA almacena archivos de registro en la carpeta RTALogs. Si se produce un error, RTA crea un archivo de
registro de error denominado *Error.txt y registra el error.
Transferencia de datos
Durante el experimento, RTA copia de manera automática los datos generados a partir de los archivos de
imágenes sin procesar en la carpeta de salida. Si el análisis de imágenes se retrasa, RTA detiene el
procesamiento y coloca la celda de flujo en un estado seguro. El procesamiento se reanuda cuando los
datos de las imágenes están disponibles.
Si RTA deja de funcionar, el procesamiento se reanudará automáticamente durante el siguiente ciclo, en el
punto adecuado de la celda de flujo. No reinicie RTA manualmente.
La transferencia de datos finaliza cuando se genera un archivo de marcador denominado Basecalling_
Netcopy_complete.txt. Se generan uno de estos archivos para cada lectura y uno para todo el experimento.
Flujo de trabajo de análisis en tiempo real
Generación de plantillas
Registro y extracción
de intensidad
Corrección de la matriz
de color
Corrección empírica de
hebras retrasadas
Llamada de bases
Puntuación de calidad
N.º de documento 15011190 v02 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
69.
Sirve para asignar las ubicaciones de grupos.
Registra la ubicación de cada grupo en la celda de flujo y determina el valor de intensidad de
cada grupo.
Corrige la comunicación cruzada entre canales.
Corrige los efectos de hebra retrasada y hebra adelantada.
Determina una llamada de bases para cada grupo.
Asigna una puntuación de calidad a cada llamada de bases.
Archivos de resultados de
64
Capítulos
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