Tabla de contenido
Capítulo 3 Secuenciación
Introducción
Para realizar un experimento de secuenciación en NextSeq 550, prepare un cartucho de reactivos y una
celda de flujo. A continuación, el software le preguntará por la configuración y se iniciará el experimento.
La generación de grupos y la secuenciación se realizan en el instrumento. Tras el experimento, se inicia un
lavado del instrumento de forma automática usando componentes cargados en él.
Generación de grupos
Durante la generación de grupos, las moléculas individuales de ADN se unen a la superficie de la celda de
flujo y, a continuación, se amplifican para formar grupos.
Secuenciación
Las imágenes de los grupos se obtienen mediante el uso de procesos químicos de secuenciación de dos
canales y combinaciones de filtro específicas para cada uno de los terminadores de cadena marcados con
fluorescencia. Tras finalizar la adquisición de imágenes de una placa en la celda de flujo, se procede a la
adquisición de imágenes de la placa siguiente. El proceso se repite para cada ciclo de secuenciación.
Después del análisis de imágenes, el software ejecuta las llamadas de bases, el filtrado y la puntuación de
calidad.
Supervise el progreso y las estadísticas del experimento en las siguientes ubicaciones.
La interfaz de NCS
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BaseSpace Sequence Hub
u
Local Run Manager
u
Un ordenador en red que use el software Sequencing Analysis Viewer (SAV). Consulte
u
Analysis Viewer en la página
Análisis
A medida que el experimento avanza, el software de control transfiere de forma automática archivos de
llamada de bases (BCL) a BaseSpace Sequence Hub, a Local Run Manager o a otra ubicación de salida
especificada para el análisis secundario.
En función de la aplicación, hay varios métodos de análisis disponibles. Para obtener más información
consulte la ayuda de BaseSpace (help.basespace.illumina.com) o la Guía del software Local Run Manager
(n.º de documento 1000000002702).
N.º de documento 15069765 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
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Sequencing
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Capítulos
Tabla de contenido
Solución de problemas
