Contenido De La Carpeta Miseqoutput (Resultadomiseq) - Illumina MiSeq Guía De Usuario

Contenido de la carpeta MiSeqOutput (ResultadoMiSeq)

Después del análisis principal, la carpeta MiSeqOutput (ResultadoMiSeq) contiene los
archivos necesarios para el análisis secundario de MiSeq Reporter. Cuando finaliza el
análisis secundario, las carpetas MiSeqOutput (ResultadoMiSeq) y MiSeqAnalysis
(AnálisisMiSeq) son idénticas excepto en que la carpeta MiSeqOutput (ResultadoMiSeq)
contiene dos subcarpetas para los archivos de imágenes: Images (Imágenes) y Thumbnail_
Images (Imágenes_miniatura). Estas no se utilizan para el análisis secundario.
Archivos
Los archivos que se copian en las carpetas de resultados y de análisis incluyen:
}
SampleSheet.csv: proporciona parámetros para el experimento y los análisis
posteriores. Al inicio del experimento, la hoja de muestras se copia en la carpeta raíz y
cambia su nombre a SampleSheet.csv. Se escriben copias en
Data\Intensities\BaseCalls.
}
runParameters.xml: contiene un resumen de los parámetros del experimento e
información sobre sus componentes, como la RFID de la celda de flujo y los reactivos
asociados al experimento.
}
RunInfo.xml: contiene información del experimento de alto nivel, como el número de
lecturas y ciclos en el experimento de secuenciación, y sobre si se ha indexado o no
una lectura.
Carpetas
Las carpetas que se copian en las carpetas de resultados y de análisis incluyen las carpetas
siguientes generadas durante el experimento de secuenciación:
}
<Nombre de carpeta de experimento>\Config: contiene los archivos de configuración
del experimento.
}
<Nombre de carpeta de experimento>\Data: contiene las subcarpetas Intensities
(Intensidades), BaseCalls (Llamadas de bases) y Alignment (Alineación). Los datos
generados por MiSeq Reporter se encuentran en la subcarpeta Alignment (Alineación).
}
<Nombre de carpeta de experimento>\Data\RTA Logs: contiene los archivos de
registro que describen cada paso realizado por RTA para cada lectura.
}
<Nombre de carpeta de experimento>\Data\Intensities\BaseCalls: contiene
subcarpetas con archivos de llamadas de bases (*.bcl), archivos de matriz y archivos
de fase. MiSeq Reporter escribe archivos FASTQ en esta carpeta durante el análisis
Guía del usuario del sistema MiSeq
Data\Intensities y
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