Tabla de contenido
}
Estimated Yield (Mb) (Rendimiento estimado [Mb]): Muestra el número de bases
previsto para el experimento, medido en megabases. Este dato aparece solo tras el
ciclo 25.
Generación de plantillas
El análisis en tiempo real (RTA) utiliza los cuatro primeros ciclos del experimento de
secuenciación para la generación de plantillas. La generación de plantillas es el proceso
por el que se definen las posiciones de los grupos de toda la superficie de la celda de flujo
de acuerdo con las coordenadas X e Y.
Una vez generada la plantilla de las posiciones de los grupos, las imágenes producidas de
cada ciclo de adquisición de imágenes posterior se alinearán con la plantilla. Se extraen las
intensidades de grupos individuales de los cuatro canales de color de nucleótidos y se
producen llamadas de bases desde las intensidades de grupos normalizadas.
Carpetas del experimento
Cada experimento del MiSeqDx genera tres carpetas del experimento, cada una con una
finalidad concreta:
}
D:\Illumina\MiSeqTemp: Cuando el experimento comienza, la carpeta temporal del
experimento se copia en la unidad local del ordenador del instrumento y se utiliza
como área de trabajo para MOS y RTA. No es preciso acceder a la carpeta temporal. El
contenido de esta carpeta se elimina al cabo de 7 días.
}
D:\Illumina\MiSeqOutput: El RTA copia los archivos de la carpeta temporal a la
carpeta de resultados. A medida que se generan los archivos del análisis principal, el
RTA vuelve a copiar los archivos en la carpeta temporal y llena la carpeta de análisis.
Las imágenes de enfoque y en miniatura no se copian en la carpeta de análisis.
Se puede cambiar la ubicación de la carpeta de resultados en el campo Output Folder
(Carpeta de resultados) de la pantalla Run Options (Opciones de experimento). Para
obtener más información, consulte
página
}
D:\Illumina\MiSeqAnalysis: Cuando haya finalizado el análisis principal, MiSeq
Reporter accederá a la carpeta de análisis de la unidad local del instrumento para
iniciar el análisis secundario. Todos los archivos generados en la carpeta Analysis
(Análisis) se copian en la carpeta Output (Resultados).
Asignación de nombres a la carpeta raíz
El nombre de la carpeta raíz del experimento identifica la fecha del experimento, el número
del instrumento y la celda de flujo utilizada para el experimento. Las carpetas de
experimento tienen el mismo nombre de carpeta raíz en todos los experimentos.
De forma predeterminada, el nombre de la carpeta utiliza este formato:
AAMMDD_<número_instrumento>_<número_experimento>_A<códigobarras_célula_
flujo>
El número del experimento aumenta en incrementos de uno cada vez que se realiza un
experimento en un instrumento determinado.
32
NOTA
La castidad de una llamada de bases es la proporción de la intensidad de la señal más alta
dividida entre la suma de las dos señales más altas. Si existe más de una llamada de bases
con un valor de castidad inferior a 0,6 en los primeros 25 ciclos, las lecturas no superan el
filtro de calidad.
21.
Pantalla Run Options (Opciones de experimento) en la
N.º de documento 1000000015779 v04 ESP
English Source: 15070067 v05
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