Conceptos De Miseq - Illumina MiSeq Guía De Usuario

Conceptos de MiSeq

Los conceptos y términos siguientes son comunes para los pasos de configuración del
experimento en MiSeq.
Concepto
Flujo de trabajo del
análisis
Manifiesto
Genoma de referencia
Carpeta del
experimento
Hoja de muestras
Para obtener información adicional sobre los flujos de trabajo del análisis y los formatos de archivo
de manifiesto, consulte la Guía del usuario de MiSeq Reporter (n.º de referencia 15042295).
Para obtener más información sobre las hojas de muestras, consulte la Guía de referencia rápida de la
hoja de muestras de MiSeq (n.º de referencia 15028392).
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Descripción
Procedimiento del análisis secundario realizado por MiSeq Reporter. El
flujo de trabajo del análisis de cada experimento se especifica en la hoja
de muestras.
Archivo que especifica el genoma de referencia y las regiones de
referencia objetivo que se deben utilizar en el paso de alineación. En el
caso de los flujos de trabajo que requieren un manifiesto, el archivo de
manifiesto se especifica en la hoja de muestras y se copia en la carpeta
de manifiesto designada en MCS.
Archivo de formato FASTA que contiene las secuencias de genoma
usadas durante el análisis. En el caso de la mayoría de los flujos de
trabajo del análisis, el archivo del genoma de referencia se especifica
en la hoja de muestras.
Estructura de carpetas que contiene el software de análisis principal
RTA (carpeta ResultadoMiSeq) o carpeta que contiene MiSeq Reporter
(MiSeqAnalysis). Para obtener información adicional, consulte
del experimento en la página
Archivo de valores separados por comas (*.csv) que almacena la
información necesaria para configurar y analizar un experimento de
secuenciación, incluida una lista de muestras y sus secuencias de índice.
La hoja de muestras debe proporcionarse durante los pasos de
configuración del experimento en MiSeq. Una vez iniciado el
experimento, se cambia el nombre de la hoja de muestras a
SampleSheet.csv y se copia en las carpetas de experimentos:
MiSeqTemp, MiSeqOutput y MiSeqAnalysis.
32.
N.° de referencia 15027617 Rev. O ESP
Carpetas