Nombre Y Ruta De La Carpeta De Resultados - Illumina iSeq 100 Manual De Uso

Guía del sistema de secuenciación iSeq 100
Tipos de archivo Descripción, ubicación y nombre del archivo
Archivos de llamada Cada placa analizada se incluye en un archivo de llamada de bases, agregado en un archivo
de bases para cada ciclo. El archivo agregado contiene la llamada de bases y la puntuación de calidad
asociada para cada grupo.
Data\Intensities\BaseCalls\L001
[Ciclo].bcl.bgzf, donde [Ciclo] representa el número de ciclo de cuatro dígitos. Los archivos de
llamadas de bases se comprimen mediante el uso de la compresión de bloques gzip.
Archivos de índice de Un archivo de índice de llamada de bases conserva la información de placa original. Para
llamadas de bases cada placa, el archivo de índice contiene el número de placa y el número de grupos.
Data\Intensities\BaseCalls\L001
[Ciclo].bcl.bgzf.bci
Archivo de ubicación Un archivo de ubicación de grupos (s.locs) contiene las coordenadas X e Y para cada grupo
de grupos de la celda de flujo.
Data\Intensities
s.locs
Archivos de filtro Los archivos de filtro determinan si los grupos superan o no el filtro. Para cada placa, se
genera un archivo de filtro. Estos archivos se generan en el ciclo 26 mediante el uso de
25 ciclos de datos.
Data\Intensities\BaseCalls\L001
s_[carril].filter
Archivos InterOp Criterios de medición en tiempo real de la calidad del experimento que se actualizan en el
transcurso del experimento. Estos archivos binarios contienen criterios de medición de placas,
ciclos y nivel de lectura, y son necesarios para visualizar los criterios de medición en
Sequencing Analysis Viewer.
Carpeta
Archivo de Incluye los parámetros del experimento. El archivo, que se crea al comienzo del experimento,
configuración de RTA combina valores del archivo de configuración de entrada y valores definidos por RTA2.
[Carpeta raíz], RTAConfiguration.xml
Archivo de Indica el nombre del experimento, el número de ciclos de cada lectura, si la lectura es una
información del Lectura del índice y el número de sectores y placas. Creado al principio del experimento.
[Carpeta raíz], RunInfo.xml
experimento*
Archivos de vistas en Imágenes en miniatura de las placas de las celdas de flujo.
Images\L001\C[X.1]: Los archivos se almacenan en una carpeta para cada carril y una
miniatura
subcarpeta para cada ciclo.
s_[carril]_[placa].jpg: La imagen en miniatura incluye el número de placa.
* Creado por el software de control. RTA2 crea todos los demás archivos que figuran en la tabla.
Local Run Manager y BaseSpace Sequence Hub convierten automáticamente los archivos de llamada de
bases en archivos FASTQ. Cuando se realice la secuenciación en el modo Manual, use la versión más
reciente del software de conversión bcl2fastq2 para convertir los archivos FASTQ. Descargue el software
desde las páginas de asistencia del software de conversión bcl2fastq

Nombre y ruta de la carpeta de resultados

Para cada experimento el software de control genera de manera automática una carpeta del experimento y
una carpeta de resultados. Acceda a los datos del experimento desde la carpeta de resultados, que es una
copia de la carpeta del experimento. La carpeta del experimento se ha concebido para su uso por parte del
sistema.
La ruta a la carpeta de resultados la define el usuario, pero su ubicación predeterminada es la unidad D:\.
El software de control asigna un nombre a la carpeta de resultados utilizando el siguiente formato.
N.º de documento 1000000036024 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
InterOp
en el sitio web de Illumina.
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