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Documentación del producto iScan System
Datos normalizados
Si la función AutoConvert estaba activada para la lectura, iCS normaliza los datos en los archivos IDAT
y genera llamadas de genotipo a partir de los datos normalizados. Los datos normalizados y las
llamadas de genotipo se guardan en archivos de llamada de genotipo (*.gtc). Para obtener más
información, consulte
Los archivos IDAT y (si procede) los GTC se guardan en el ordenador de control del instrumento o en
red en la subcarpeta de ID del BeadChip (identificador de código de barras), en la carpeta de ruta de
salida.
Información de configuración del lector
Al inicio de una lectura se crea el archivo Effective.cfg. Este archivo contiene toda la información de
configuración del lector para la lectura actual. Se guarda en la carpeta de ID del BeadChip en la ruta de
salida.
Imágenes
Cada archivo de imagen (*.tiff, *.jpeg o *.png) se guarda en el ordenador de control del instrumento o
en red. Los archivos de imagen se guardan en la carpeta de ID del BeadChip (identificador de código de
barras), en la carpeta de ruta de salida. Los nombres de archivo para cada nodo individual se generan
en función de la posición de la sección en el BeadChip.
El nombre de los archivos se define usando la siguiente nomenclatura: ID_ETIQUETA_LÍNEA_SECTOR_
EXTENSIÓN.CANAL
Componente
del nombre
Descripción
de archivo
ID
El número de serie (o código de barras) del BeadChip.
Etiqueta
Se refiere a la ubicación de la muestra en el BeadChip.
•
Los chips cuádruples se etiquetan con el formato siguiente: R01C01,
R02C01, R01C02, R02C02
•
Los chips dobles se etiquetan con el formato siguiente: A, B
Línea
Sección numerada empezando por la parte superior izquierda de una muestra
en un BeadChip.
Sector
Se obtienen imágenes de algunas líneas del BeadChip utilizando dos o tres
líneas más pequeñas, que se denominan sectores. El nombre del sector hace
referencia a la ubicación de la imagen en cada línea. En una línea de
2 sectores, por ejemplo, Sector 1 es la imagen de la mitad superior de la líneas
y Sector 2 es la imagen de la mitad inferior de la línea.
Documento n.º 1000000161301 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Generación de datos normalizados y llamadas de genotipo en la página 32
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