Tabla de contenido
Leica Microsystems Heidelberg GmbH
Funciones del software LCS:
Descripción de cada función
gracias al denominado análisis de conglomerados. Un análisis de conglomerados es un proceso
matemático para la distribución de objetos en grupos homogéneos (Cluster). La distribución en
grupos se realiza mediante una variable, es decir, una característica que describe a todos los objetos
analizados. Un grupo es homogéneo cuando sus objetos son bastante parecidos en relación a la
variable (la característica).
Este método de clasificación matemático se aplica al problema de las señales fluorescentes que se
solapan. Los objetos que se desea clasificar son los valores de intensidad (valores grises del píxel)
capturados en diferentes canales de detección (gamas de longitud de onda). Si se representan todas
las combinaciones de estos valores de intensidad en el denominado espacio de característica, existe
la posibilidad de clasificarlos en grupos, es decir, asignarlos a una tintura fluorescente. Como variable
de característica se utiliza la altura del valor de intensidad en cada canal de detección.
(3)
Los valores de intensidad (valores
(4)
Objetos en espacio de característica tridimensional
grises) procedentes de los distintos
Cada punto representa un trío de valores de
canales de detección se resumen en
intensidad
vectores
Para la aplicación de análisis de conglomerados se representan las combinaciones de valores de
intensidad como puntos en el espacio de característica
(4)
. A diferencia del espacio "espacial" con
sus tres ejes espaciales, el espacio de característica es un espacio geométrico cuyas dimensiones se
crean a partir de variables. En el caso de los bloques de datos de imágenes analizados en la
microscopía de fluorescencia, los ejes del espacio de característica son los valores de intensidad
medidos en los diferentes canales de detección (gamas de longitud de onda)
(3)
. Cada punto del
espacio de característica se caracteriza mediante un vector.
Pasos individuales del análisis de conglomerados
Los dos primeros pasos del análisis de conglomerados permiten la reducción de la cantidad de datos
y, de esta forma, la aceleración del cálculo. En el primer paso se eliminan aquellos puntos que se
encuentran muy cerca del origen del espacio de característica
(5)
. Estos datos que se encuentran en
la gama de valores inferiores son ruidos, que no aportan ninguna información sobre el preparado y
por ello pueden eliminarse. El segundo paso consiste en proyectar los puntos diseminados por el
espacio de característica sobre la bola de unidad, una bola con radio 1
(6)
.
Manual del usuario de Leica TCS SP2 español
Art. n.º: 159330056 / Vers.: 31102002
Página 231 de 320
Tabla de contenido
